Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP8

Brap, BRCA1-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrapQ99MP8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BrapQ99MP8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BrapQ99MP8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BrapQ99MP8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BrapQ99MP8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BrapQ99MP8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BrapQ99MP8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BrapQ99MP8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BrapQ99MP8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BrapQ99MP8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BrapQ99MP8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BrapQ99MP8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BrapQ99MP8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BrapQ99MP8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BrapQ99MP8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BrapQ99MP8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BrapQ99MP8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BrapQ99MP8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BrapQ99MP8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BrapQ99MP8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BrapQ99MP8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BrapQ99MP8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BrapQ99MP8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BrapQ99MP8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BrapQ99MP8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BrapQ99MP8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BrapQ99MP8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BrapQ99MP8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BrapQ99MP8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BrapQ99MP8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BrapQ99MP8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BrapQ99MP8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
BrapQ99MP8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BrapQ99MP8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BrapQ99MP8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BrapQ99MP8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BrapQ99MP8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BrapQ99MP8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BrapQ99MP8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BrapQ99MP8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BrapQ99MP8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BrapQ99MP8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BrapQ99MP8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BrapQ99MP8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BrapQ99MP8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BrapQ99MP8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BrapQ99MP8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BrapQ99MP8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BrapQ99MP8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BrapQ99MP8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
BrapQ99MP8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BrapQ99MP8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BrapQ99MP8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BrapQ99MP8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BrapQ99MP8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BrapQ99MP8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BrapQ99MP8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
BrapQ99MP8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BrapQ99MP8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BrapQ99MP8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BrapQ99MP8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BrapQ99MP8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BrapQ99MP8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BrapQ99MP8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BrapQ99MP8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BrapQ99MP8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
BrapQ99MP8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BrapQ99MP8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BrapQ99MP8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BrapQ99MP8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BrapQ99MP8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BrapQ99MP8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BrapQ99MP8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BrapQ99MP8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
BrapQ99MP8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BrapQ99MP8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BrapQ99MP8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BrapQ99MP8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BrapQ99MP8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BrapQ99MP8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BrapQ99MP8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BrapQ99MP8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BrapQ99MP8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BrapQ99MP8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BrapQ99MP8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BrapQ99MP8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BrapQ99MP8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BrapQ99MP8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BrapQ99MP8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BrapQ99MP8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BrapQ99MP8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BrapQ99MP8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BrapQ99MP8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BrapQ99MP8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BrapQ99MP8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BrapQ99MP8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BrapQ99MP8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BrapQ99MP8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BrapQ99MP8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BrapQ99MP8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.7 ms