Protein–RNA interactions for Protein: Q99K23

Ufsp2, Ufm1-specific protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp2Q99K23 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ufsp2Q99K23 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ufsp2Q99K23 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ufsp2Q99K23 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ufsp2Q99K23 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ufsp2Q99K23 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ufsp2Q99K23 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ufsp2Q99K23 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ufsp2Q99K23 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ufsp2Q99K23 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ufsp2Q99K23 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ufsp2Q99K23 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ufsp2Q99K23 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ufsp2Q99K23 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ufsp2Q99K23 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ufsp2Q99K23 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ufsp2Q99K23 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ufsp2Q99K23 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ufsp2Q99K23 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ufsp2Q99K23 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ufsp2Q99K23 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ufsp2Q99K23 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ufsp2Q99K23 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ufsp2Q99K23 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ufsp2Q99K23 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ufsp2Q99K23 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ufsp2Q99K23 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ufsp2Q99K23 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ufsp2Q99K23 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ufsp2Q99K23 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ufsp2Q99K23 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ufsp2Q99K23 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ufsp2Q99K23 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ufsp2Q99K23 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ufsp2Q99K23 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ufsp2Q99K23 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ufsp2Q99K23 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ufsp2Q99K23 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ufsp2Q99K23 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ufsp2Q99K23 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ufsp2Q99K23 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ufsp2Q99K23 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ufsp2Q99K23 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ufsp2Q99K23 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ufsp2Q99K23 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ufsp2Q99K23 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ufsp2Q99K23 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ufsp2Q99K23 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ufsp2Q99K23 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ufsp2Q99K23 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ufsp2Q99K23 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ufsp2Q99K23 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ufsp2Q99K23 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ufsp2Q99K23 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ufsp2Q99K23 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ufsp2Q99K23 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ufsp2Q99K23 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ufsp2Q99K23 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ufsp2Q99K23 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ufsp2Q99K23 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ufsp2Q99K23 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ufsp2Q99K23 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ufsp2Q99K23 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ufsp2Q99K23 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ufsp2Q99K23 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ufsp2Q99K23 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ufsp2Q99K23 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ufsp2Q99K23 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ufsp2Q99K23 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ufsp2Q99K23 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ufsp2Q99K23 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ufsp2Q99K23 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ufsp2Q99K23 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ufsp2Q99K23 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ufsp2Q99K23 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ufsp2Q99K23 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ufsp2Q99K23 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ufsp2Q99K23 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ufsp2Q99K23 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ufsp2Q99K23 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ufsp2Q99K23 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ufsp2Q99K23 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ufsp2Q99K23 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ufsp2Q99K23 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ufsp2Q99K23 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ufsp2Q99K23 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ufsp2Q99K23 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ufsp2Q99K23 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ufsp2Q99K23 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ufsp2Q99K23 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ufsp2Q99K23 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ufsp2Q99K23 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ufsp2Q99K23 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ufsp2Q99K23 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ufsp2Q99K23 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ufsp2Q99K23 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ufsp2Q99K23 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ufsp2Q99K23 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ufsp2Q99K23 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ufsp2Q99K23 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms