Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Higd1bQ99JY6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Higd1bQ99JY6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Higd1bQ99JY6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Higd1bQ99JY6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Higd1bQ99JY6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Higd1bQ99JY6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Higd1bQ99JY6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Higd1bQ99JY6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Higd1bQ99JY6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Higd1bQ99JY6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Higd1bQ99JY6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Higd1bQ99JY6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Higd1bQ99JY6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Higd1bQ99JY6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Higd1bQ99JY6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Higd1bQ99JY6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Higd1bQ99JY6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Higd1bQ99JY6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Higd1bQ99JY6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Higd1bQ99JY6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Higd1bQ99JY6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Higd1bQ99JY6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Higd1bQ99JY6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Higd1bQ99JY6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Higd1bQ99JY6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Higd1bQ99JY6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Higd1bQ99JY6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Higd1bQ99JY6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Higd1bQ99JY6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Higd1bQ99JY6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Higd1bQ99JY6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Higd1bQ99JY6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Higd1bQ99JY6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Higd1bQ99JY6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Higd1bQ99JY6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Higd1bQ99JY6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Higd1bQ99JY6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Higd1bQ99JY6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Higd1bQ99JY6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Higd1bQ99JY6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Higd1bQ99JY6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Higd1bQ99JY6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Higd1bQ99JY6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Higd1bQ99JY6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Higd1bQ99JY6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Higd1bQ99JY6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Higd1bQ99JY6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Higd1bQ99JY6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Higd1bQ99JY6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Higd1bQ99JY6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Higd1bQ99JY6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Higd1bQ99JY6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Higd1bQ99JY6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Higd1bQ99JY6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Higd1bQ99JY6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Higd1bQ99JY6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Higd1bQ99JY6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Higd1bQ99JY6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Higd1bQ99JY6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Higd1bQ99JY6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Higd1bQ99JY6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Higd1bQ99JY6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Higd1bQ99JY6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Higd1bQ99JY6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Higd1bQ99JY6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Higd1bQ99JY6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Higd1bQ99JY6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Higd1bQ99JY6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Higd1bQ99JY6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Higd1bQ99JY6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Higd1bQ99JY6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Higd1bQ99JY6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Higd1bQ99JY6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Higd1bQ99JY6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Higd1bQ99JY6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Higd1bQ99JY6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Higd1bQ99JY6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Higd1bQ99JY6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Higd1bQ99JY6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Higd1bQ99JY6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Higd1bQ99JY6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Higd1bQ99JY6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Higd1bQ99JY6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Higd1bQ99JY6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Higd1bQ99JY6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Higd1bQ99JY6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Higd1bQ99JY6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Higd1bQ99JY6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Higd1bQ99JY6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Higd1bQ99JY6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Higd1bQ99JY6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Higd1bQ99JY6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Higd1bQ99JY6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Higd1bQ99JY6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Higd1bQ99JY6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Higd1bQ99JY6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Higd1bQ99JY6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Higd1bQ99JY6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Higd1bQ99JY6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms