Protein–RNA interactions for Protein: Q99JX7

Nxf1, Nuclear RNA export factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxf1Q99JX7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nxf1Q99JX7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nxf1Q99JX7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nxf1Q99JX7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nxf1Q99JX7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nxf1Q99JX7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nxf1Q99JX7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nxf1Q99JX7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nxf1Q99JX7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Nxf1Q99JX7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nxf1Q99JX7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nxf1Q99JX7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nxf1Q99JX7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nxf1Q99JX7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nxf1Q99JX7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nxf1Q99JX7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nxf1Q99JX7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nxf1Q99JX7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nxf1Q99JX7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nxf1Q99JX7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nxf1Q99JX7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nxf1Q99JX7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nxf1Q99JX7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nxf1Q99JX7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nxf1Q99JX7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nxf1Q99JX7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nxf1Q99JX7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nxf1Q99JX7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nxf1Q99JX7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nxf1Q99JX7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nxf1Q99JX7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nxf1Q99JX7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nxf1Q99JX7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nxf1Q99JX7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nxf1Q99JX7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nxf1Q99JX7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nxf1Q99JX7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nxf1Q99JX7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nxf1Q99JX7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nxf1Q99JX7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nxf1Q99JX7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nxf1Q99JX7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nxf1Q99JX7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nxf1Q99JX7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nxf1Q99JX7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nxf1Q99JX7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nxf1Q99JX7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nxf1Q99JX7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Nxf1Q99JX7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nxf1Q99JX7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nxf1Q99JX7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nxf1Q99JX7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nxf1Q99JX7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nxf1Q99JX7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nxf1Q99JX7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nxf1Q99JX7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nxf1Q99JX7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nxf1Q99JX7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nxf1Q99JX7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nxf1Q99JX7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nxf1Q99JX7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Nxf1Q99JX7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nxf1Q99JX7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Nxf1Q99JX7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nxf1Q99JX7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nxf1Q99JX7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nxf1Q99JX7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nxf1Q99JX7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nxf1Q99JX7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nxf1Q99JX7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nxf1Q99JX7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nxf1Q99JX7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nxf1Q99JX7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nxf1Q99JX7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nxf1Q99JX7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nxf1Q99JX7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nxf1Q99JX7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nxf1Q99JX7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nxf1Q99JX7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nxf1Q99JX7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nxf1Q99JX7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nxf1Q99JX7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Nxf1Q99JX7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nxf1Q99JX7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nxf1Q99JX7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nxf1Q99JX7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Nxf1Q99JX7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nxf1Q99JX7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nxf1Q99JX7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nxf1Q99JX7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nxf1Q99JX7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nxf1Q99JX7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nxf1Q99JX7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nxf1Q99JX7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nxf1Q99JX7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nxf1Q99JX7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nxf1Q99JX7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nxf1Q99JX7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nxf1Q99JX7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nxf1Q99JX7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms