Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rrp1bQ91YK2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rrp1bQ91YK2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rrp1bQ91YK2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rrp1bQ91YK2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rrp1bQ91YK2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rrp1bQ91YK2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rrp1bQ91YK2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rrp1bQ91YK2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rrp1bQ91YK2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rrp1bQ91YK2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rrp1bQ91YK2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rrp1bQ91YK2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rrp1bQ91YK2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rrp1bQ91YK2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rrp1bQ91YK2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rrp1bQ91YK2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rrp1bQ91YK2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rrp1bQ91YK2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rrp1bQ91YK2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rrp1bQ91YK2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rrp1bQ91YK2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rrp1bQ91YK2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rrp1bQ91YK2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rrp1bQ91YK2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rrp1bQ91YK2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rrp1bQ91YK2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rrp1bQ91YK2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rrp1bQ91YK2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rrp1bQ91YK2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rrp1bQ91YK2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rrp1bQ91YK2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rrp1bQ91YK2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rrp1bQ91YK2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rrp1bQ91YK2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rrp1bQ91YK2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rrp1bQ91YK2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rrp1bQ91YK2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rrp1bQ91YK2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rrp1bQ91YK2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rrp1bQ91YK2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rrp1bQ91YK2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rrp1bQ91YK2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rrp1bQ91YK2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rrp1bQ91YK2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rrp1bQ91YK2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rrp1bQ91YK2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rrp1bQ91YK2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rrp1bQ91YK2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrp1bQ91YK2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrp1bQ91YK2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrp1bQ91YK2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrp1bQ91YK2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrp1bQ91YK2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrp1bQ91YK2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rrp1bQ91YK2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rrp1bQ91YK2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rrp1bQ91YK2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rrp1bQ91YK2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rrp1bQ91YK2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rrp1bQ91YK2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rrp1bQ91YK2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rrp1bQ91YK2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rrp1bQ91YK2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rrp1bQ91YK2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rrp1bQ91YK2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rrp1bQ91YK2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rrp1bQ91YK2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rrp1bQ91YK2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rrp1bQ91YK2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rrp1bQ91YK2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rrp1bQ91YK2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rrp1bQ91YK2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rrp1bQ91YK2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rrp1bQ91YK2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rrp1bQ91YK2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rrp1bQ91YK2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rrp1bQ91YK2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrp1bQ91YK2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrp1bQ91YK2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrp1bQ91YK2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrp1bQ91YK2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrp1bQ91YK2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrp1bQ91YK2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rrp1bQ91YK2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rrp1bQ91YK2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rrp1bQ91YK2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrp1bQ91YK2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrp1bQ91YK2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrp1bQ91YK2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrp1bQ91YK2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrp1bQ91YK2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrp1bQ91YK2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrp1bQ91YK2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrp1bQ91YK2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrp1bQ91YK2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrp1bQ91YK2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rrp1bQ91YK2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rrp1bQ91YK2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rrp1bQ91YK2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms