Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx4Q91YJ2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx4Q91YJ2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx4Q91YJ2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx4Q91YJ2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx4Q91YJ2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx4Q91YJ2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx4Q91YJ2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx4Q91YJ2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx4Q91YJ2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snx4Q91YJ2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snx4Q91YJ2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snx4Q91YJ2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx4Q91YJ2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx4Q91YJ2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx4Q91YJ2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx4Q91YJ2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx4Q91YJ2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx4Q91YJ2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx4Q91YJ2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx4Q91YJ2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx4Q91YJ2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx4Q91YJ2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx4Q91YJ2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx4Q91YJ2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx4Q91YJ2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx4Q91YJ2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx4Q91YJ2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx4Q91YJ2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx4Q91YJ2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx4Q91YJ2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx4Q91YJ2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx4Q91YJ2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx4Q91YJ2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx4Q91YJ2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx4Q91YJ2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx4Q91YJ2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx4Q91YJ2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx4Q91YJ2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx4Q91YJ2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx4Q91YJ2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx4Q91YJ2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx4Q91YJ2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx4Q91YJ2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx4Q91YJ2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx4Q91YJ2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx4Q91YJ2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx4Q91YJ2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx4Q91YJ2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx4Q91YJ2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx4Q91YJ2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx4Q91YJ2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx4Q91YJ2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx4Q91YJ2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx4Q91YJ2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx4Q91YJ2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx4Q91YJ2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx4Q91YJ2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx4Q91YJ2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx4Q91YJ2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx4Q91YJ2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx4Q91YJ2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx4Q91YJ2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx4Q91YJ2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx4Q91YJ2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx4Q91YJ2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx4Q91YJ2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx4Q91YJ2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx4Q91YJ2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx4Q91YJ2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx4Q91YJ2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx4Q91YJ2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx4Q91YJ2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx4Q91YJ2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx4Q91YJ2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx4Q91YJ2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx4Q91YJ2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx4Q91YJ2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx4Q91YJ2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx4Q91YJ2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx4Q91YJ2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx4Q91YJ2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx4Q91YJ2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx4Q91YJ2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx4Q91YJ2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx4Q91YJ2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx4Q91YJ2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Snx4Q91YJ2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx4Q91YJ2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms