Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y16

Pcdha3, Protocadherin alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha3Q91Y16 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdha3Q91Y16 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdha3Q91Y16 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdha3Q91Y16 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdha3Q91Y16 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdha3Q91Y16 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha3Q91Y16 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha3Q91Y16 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha3Q91Y16 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha3Q91Y16 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha3Q91Y16 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha3Q91Y16 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha3Q91Y16 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha3Q91Y16 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha3Q91Y16 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha3Q91Y16 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha3Q91Y16 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha3Q91Y16 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha3Q91Y16 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha3Q91Y16 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha3Q91Y16 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha3Q91Y16 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha3Q91Y16 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha3Q91Y16 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha3Q91Y16 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha3Q91Y16 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha3Q91Y16 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha3Q91Y16 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha3Q91Y16 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcdha3Q91Y16 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdha3Q91Y16 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdha3Q91Y16 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdha3Q91Y16 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdha3Q91Y16 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdha3Q91Y16 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdha3Q91Y16 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdha3Q91Y16 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdha3Q91Y16 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdha3Q91Y16 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdha3Q91Y16 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha3Q91Y16 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha3Q91Y16 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha3Q91Y16 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha3Q91Y16 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha3Q91Y16 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha3Q91Y16 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha3Q91Y16 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdha3Q91Y16 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdha3Q91Y16 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdha3Q91Y16 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdha3Q91Y16 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdha3Q91Y16 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdha3Q91Y16 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdha3Q91Y16 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdha3Q91Y16 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdha3Q91Y16 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdha3Q91Y16 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdha3Q91Y16 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdha3Q91Y16 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdha3Q91Y16 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdha3Q91Y16 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdha3Q91Y16 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdha3Q91Y16 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdha3Q91Y16 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdha3Q91Y16 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pcdha3Q91Y16 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pcdha3Q91Y16 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdha3Q91Y16 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdha3Q91Y16 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdha3Q91Y16 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdha3Q91Y16 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdha3Q91Y16 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdha3Q91Y16 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdha3Q91Y16 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdha3Q91Y16 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdha3Q91Y16 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdha3Q91Y16 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha3Q91Y16 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha3Q91Y16 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha3Q91Y16 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha3Q91Y16 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha3Q91Y16 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha3Q91Y16 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha3Q91Y16 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha3Q91Y16 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha3Q91Y16 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha3Q91Y16 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha3Q91Y16 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha3Q91Y16 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha3Q91Y16 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha3Q91Y16 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdha3Q91Y16 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdha3Q91Y16 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdha3Q91Y16 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdha3Q91Y16 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdha3Q91Y16 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdha3Q91Y16 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdha3Q91Y16 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdha3Q91Y16 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdha3Q91Y16 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms