Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD3

Tm4sf4, Transmembrane 4 L6 family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf4Q91XD3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tm4sf4Q91XD3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tm4sf4Q91XD3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tm4sf4Q91XD3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tm4sf4Q91XD3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tm4sf4Q91XD3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tm4sf4Q91XD3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tm4sf4Q91XD3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tm4sf4Q91XD3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tm4sf4Q91XD3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tm4sf4Q91XD3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tm4sf4Q91XD3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tm4sf4Q91XD3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Tm4sf4Q91XD3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tm4sf4Q91XD3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tm4sf4Q91XD3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tm4sf4Q91XD3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tm4sf4Q91XD3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Tm4sf4Q91XD3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tm4sf4Q91XD3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tm4sf4Q91XD3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tm4sf4Q91XD3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tm4sf4Q91XD3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tm4sf4Q91XD3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tm4sf4Q91XD3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tm4sf4Q91XD3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tm4sf4Q91XD3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tm4sf4Q91XD3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tm4sf4Q91XD3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tm4sf4Q91XD3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tm4sf4Q91XD3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tm4sf4Q91XD3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tm4sf4Q91XD3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tm4sf4Q91XD3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tm4sf4Q91XD3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tm4sf4Q91XD3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tm4sf4Q91XD3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tm4sf4Q91XD3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Tm4sf4Q91XD3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Tm4sf4Q91XD3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Tm4sf4Q91XD3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tm4sf4Q91XD3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tm4sf4Q91XD3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tm4sf4Q91XD3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tm4sf4Q91XD3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tm4sf4Q91XD3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tm4sf4Q91XD3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tm4sf4Q91XD3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tm4sf4Q91XD3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tm4sf4Q91XD3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tm4sf4Q91XD3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tm4sf4Q91XD3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tm4sf4Q91XD3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tm4sf4Q91XD3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tm4sf4Q91XD3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Tm4sf4Q91XD3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tm4sf4Q91XD3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tm4sf4Q91XD3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tm4sf4Q91XD3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tm4sf4Q91XD3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tm4sf4Q91XD3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tm4sf4Q91XD3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tm4sf4Q91XD3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tm4sf4Q91XD3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tm4sf4Q91XD3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Tm4sf4Q91XD3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tm4sf4Q91XD3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tm4sf4Q91XD3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tm4sf4Q91XD3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tm4sf4Q91XD3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tm4sf4Q91XD3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tm4sf4Q91XD3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tm4sf4Q91XD3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tm4sf4Q91XD3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tm4sf4Q91XD3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tm4sf4Q91XD3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tm4sf4Q91XD3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tm4sf4Q91XD3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Tm4sf4Q91XD3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tm4sf4Q91XD3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tm4sf4Q91XD3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tm4sf4Q91XD3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tm4sf4Q91XD3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tm4sf4Q91XD3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tm4sf4Q91XD3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tm4sf4Q91XD3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tm4sf4Q91XD3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tm4sf4Q91XD3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tm4sf4Q91XD3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tm4sf4Q91XD3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tm4sf4Q91XD3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tm4sf4Q91XD3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tm4sf4Q91XD3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tm4sf4Q91XD3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tm4sf4Q91XD3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tm4sf4Q91XD3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tm4sf4Q91XD3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tm4sf4Q91XD3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tm4sf4Q91XD3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Tm4sf4Q91XD3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms