Protein–RNA interactions for Protein: Q91WM3

Rrp9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp9Q91WM3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rrp9Q91WM3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rrp9Q91WM3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rrp9Q91WM3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rrp9Q91WM3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rrp9Q91WM3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rrp9Q91WM3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rrp9Q91WM3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rrp9Q91WM3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rrp9Q91WM3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rrp9Q91WM3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rrp9Q91WM3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rrp9Q91WM3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rrp9Q91WM3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rrp9Q91WM3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rrp9Q91WM3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rrp9Q91WM3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rrp9Q91WM3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rrp9Q91WM3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rrp9Q91WM3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rrp9Q91WM3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rrp9Q91WM3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rrp9Q91WM3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rrp9Q91WM3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rrp9Q91WM3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rrp9Q91WM3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rrp9Q91WM3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rrp9Q91WM3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rrp9Q91WM3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rrp9Q91WM3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rrp9Q91WM3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rrp9Q91WM3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rrp9Q91WM3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rrp9Q91WM3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rrp9Q91WM3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rrp9Q91WM3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rrp9Q91WM3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rrp9Q91WM3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rrp9Q91WM3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rrp9Q91WM3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rrp9Q91WM3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rrp9Q91WM3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rrp9Q91WM3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rrp9Q91WM3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rrp9Q91WM3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rrp9Q91WM3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rrp9Q91WM3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rrp9Q91WM3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rrp9Q91WM3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rrp9Q91WM3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrp9Q91WM3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrp9Q91WM3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrp9Q91WM3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrp9Q91WM3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrp9Q91WM3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrp9Q91WM3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrp9Q91WM3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rrp9Q91WM3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rrp9Q91WM3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rrp9Q91WM3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rrp9Q91WM3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rrp9Q91WM3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rrp9Q91WM3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rrp9Q91WM3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rrp9Q91WM3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rrp9Q91WM3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rrp9Q91WM3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrp9Q91WM3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrp9Q91WM3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrp9Q91WM3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrp9Q91WM3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrp9Q91WM3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrp9Q91WM3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rrp9Q91WM3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rrp9Q91WM3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rrp9Q91WM3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rrp9Q91WM3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rrp9Q91WM3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rrp9Q91WM3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rrp9Q91WM3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rrp9Q91WM3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rrp9Q91WM3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rrp9Q91WM3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rrp9Q91WM3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rrp9Q91WM3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rrp9Q91WM3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rrp9Q91WM3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rrp9Q91WM3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rrp9Q91WM3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rrp9Q91WM3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rrp9Q91WM3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rrp9Q91WM3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rrp9Q91WM3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rrp9Q91WM3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rrp9Q91WM3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rrp9Q91WM3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rrp9Q91WM3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rrp9Q91WM3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rrp9Q91WM3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrp9Q91WM3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms