Protein–RNA interactions for Protein: Q91WK5

Gcsh, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcshQ91WK5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GcshQ91WK5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GcshQ91WK5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GcshQ91WK5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GcshQ91WK5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GcshQ91WK5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GcshQ91WK5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GcshQ91WK5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GcshQ91WK5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GcshQ91WK5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GcshQ91WK5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GcshQ91WK5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GcshQ91WK5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GcshQ91WK5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GcshQ91WK5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GcshQ91WK5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GcshQ91WK5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GcshQ91WK5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GcshQ91WK5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GcshQ91WK5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GcshQ91WK5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GcshQ91WK5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GcshQ91WK5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GcshQ91WK5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GcshQ91WK5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GcshQ91WK5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GcshQ91WK5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GcshQ91WK5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GcshQ91WK5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GcshQ91WK5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GcshQ91WK5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GcshQ91WK5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GcshQ91WK5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GcshQ91WK5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GcshQ91WK5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GcshQ91WK5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GcshQ91WK5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GcshQ91WK5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GcshQ91WK5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GcshQ91WK5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GcshQ91WK5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GcshQ91WK5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GcshQ91WK5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GcshQ91WK5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GcshQ91WK5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GcshQ91WK5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GcshQ91WK5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GcshQ91WK5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GcshQ91WK5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GcshQ91WK5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GcshQ91WK5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GcshQ91WK5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GcshQ91WK5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GcshQ91WK5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GcshQ91WK5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GcshQ91WK5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GcshQ91WK5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GcshQ91WK5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GcshQ91WK5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GcshQ91WK5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GcshQ91WK5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GcshQ91WK5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GcshQ91WK5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GcshQ91WK5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GcshQ91WK5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GcshQ91WK5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GcshQ91WK5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GcshQ91WK5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GcshQ91WK5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GcshQ91WK5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GcshQ91WK5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GcshQ91WK5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GcshQ91WK5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GcshQ91WK5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GcshQ91WK5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GcshQ91WK5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GcshQ91WK5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GcshQ91WK5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GcshQ91WK5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GcshQ91WK5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GcshQ91WK5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GcshQ91WK5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GcshQ91WK5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GcshQ91WK5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GcshQ91WK5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GcshQ91WK5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GcshQ91WK5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GcshQ91WK5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GcshQ91WK5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GcshQ91WK5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GcshQ91WK5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GcshQ91WK5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GcshQ91WK5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GcshQ91WK5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GcshQ91WK5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GcshQ91WK5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GcshQ91WK5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GcshQ91WK5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GcshQ91WK5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GcshQ91WK5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms