Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHI7

Ccdc65, Coiled-coil domain-containing protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc65Q8VHI7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc65Q8VHI7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc65Q8VHI7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc65Q8VHI7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc65Q8VHI7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc65Q8VHI7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc65Q8VHI7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc65Q8VHI7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc65Q8VHI7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc65Q8VHI7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc65Q8VHI7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc65Q8VHI7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc65Q8VHI7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc65Q8VHI7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc65Q8VHI7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc65Q8VHI7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc65Q8VHI7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc65Q8VHI7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc65Q8VHI7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc65Q8VHI7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc65Q8VHI7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc65Q8VHI7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc65Q8VHI7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc65Q8VHI7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc65Q8VHI7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc65Q8VHI7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc65Q8VHI7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc65Q8VHI7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc65Q8VHI7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc65Q8VHI7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc65Q8VHI7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc65Q8VHI7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc65Q8VHI7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc65Q8VHI7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc65Q8VHI7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc65Q8VHI7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc65Q8VHI7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc65Q8VHI7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc65Q8VHI7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc65Q8VHI7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc65Q8VHI7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc65Q8VHI7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc65Q8VHI7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc65Q8VHI7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc65Q8VHI7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc65Q8VHI7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc65Q8VHI7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc65Q8VHI7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc65Q8VHI7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc65Q8VHI7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc65Q8VHI7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc65Q8VHI7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc65Q8VHI7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc65Q8VHI7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc65Q8VHI7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc65Q8VHI7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc65Q8VHI7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc65Q8VHI7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc65Q8VHI7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc65Q8VHI7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc65Q8VHI7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc65Q8VHI7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc65Q8VHI7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc65Q8VHI7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc65Q8VHI7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc65Q8VHI7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc65Q8VHI7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc65Q8VHI7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc65Q8VHI7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc65Q8VHI7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc65Q8VHI7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc65Q8VHI7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc65Q8VHI7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc65Q8VHI7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc65Q8VHI7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc65Q8VHI7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc65Q8VHI7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc65Q8VHI7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc65Q8VHI7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc65Q8VHI7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc65Q8VHI7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc65Q8VHI7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc65Q8VHI7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc65Q8VHI7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc65Q8VHI7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc65Q8VHI7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc65Q8VHI7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc65Q8VHI7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc65Q8VHI7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc65Q8VHI7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc65Q8VHI7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc65Q8VHI7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc65Q8VHI7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc65Q8VHI7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc65Q8VHI7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc65Q8VHI7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc65Q8VHI7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc65Q8VHI7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc65Q8VHI7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc65Q8VHI7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 444.4 ms