Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEF1

Gramd1a, GRAM domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd1aQ8VEF1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gramd1aQ8VEF1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gramd1aQ8VEF1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gramd1aQ8VEF1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gramd1aQ8VEF1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gramd1aQ8VEF1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gramd1aQ8VEF1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gramd1aQ8VEF1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gramd1aQ8VEF1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gramd1aQ8VEF1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gramd1aQ8VEF1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gramd1aQ8VEF1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gramd1aQ8VEF1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gramd1aQ8VEF1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gramd1aQ8VEF1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gramd1aQ8VEF1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gramd1aQ8VEF1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gramd1aQ8VEF1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gramd1aQ8VEF1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gramd1aQ8VEF1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gramd1aQ8VEF1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gramd1aQ8VEF1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gramd1aQ8VEF1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gramd1aQ8VEF1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gramd1aQ8VEF1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gramd1aQ8VEF1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gramd1aQ8VEF1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gramd1aQ8VEF1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gramd1aQ8VEF1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gramd1aQ8VEF1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gramd1aQ8VEF1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gramd1aQ8VEF1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gramd1aQ8VEF1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gramd1aQ8VEF1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gramd1aQ8VEF1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gramd1aQ8VEF1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gramd1aQ8VEF1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gramd1aQ8VEF1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gramd1aQ8VEF1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gramd1aQ8VEF1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gramd1aQ8VEF1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gramd1aQ8VEF1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gramd1aQ8VEF1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gramd1aQ8VEF1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gramd1aQ8VEF1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gramd1aQ8VEF1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gramd1aQ8VEF1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gramd1aQ8VEF1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gramd1aQ8VEF1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gramd1aQ8VEF1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gramd1aQ8VEF1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gramd1aQ8VEF1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gramd1aQ8VEF1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gramd1aQ8VEF1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gramd1aQ8VEF1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gramd1aQ8VEF1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gramd1aQ8VEF1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gramd1aQ8VEF1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gramd1aQ8VEF1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gramd1aQ8VEF1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gramd1aQ8VEF1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gramd1aQ8VEF1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gramd1aQ8VEF1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gramd1aQ8VEF1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gramd1aQ8VEF1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gramd1aQ8VEF1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gramd1aQ8VEF1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gramd1aQ8VEF1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gramd1aQ8VEF1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gramd1aQ8VEF1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gramd1aQ8VEF1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gramd1aQ8VEF1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gramd1aQ8VEF1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gramd1aQ8VEF1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gramd1aQ8VEF1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gramd1aQ8VEF1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gramd1aQ8VEF1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gramd1aQ8VEF1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gramd1aQ8VEF1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gramd1aQ8VEF1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gramd1aQ8VEF1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gramd1aQ8VEF1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gramd1aQ8VEF1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gramd1aQ8VEF1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gramd1aQ8VEF1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gramd1aQ8VEF1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gramd1aQ8VEF1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gramd1aQ8VEF1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gramd1aQ8VEF1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gramd1aQ8VEF1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gramd1aQ8VEF1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gramd1aQ8VEF1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gramd1aQ8VEF1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gramd1aQ8VEF1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gramd1aQ8VEF1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gramd1aQ8VEF1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gramd1aQ8VEF1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gramd1aQ8VEF1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gramd1aQ8VEF1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gramd1aQ8VEF1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms