Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD76

Gtf2h3, General transcription factor IIH subunit 3, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2h3Q8VD76 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gtf2h3Q8VD76 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2h3Q8VD76 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2h3Q8VD76 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2h3Q8VD76 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2h3Q8VD76 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2h3Q8VD76 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2h3Q8VD76 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2h3Q8VD76 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2h3Q8VD76 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2h3Q8VD76 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2h3Q8VD76 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2h3Q8VD76 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2h3Q8VD76 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2h3Q8VD76 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2h3Q8VD76 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2h3Q8VD76 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2h3Q8VD76 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2h3Q8VD76 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2h3Q8VD76 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2h3Q8VD76 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2h3Q8VD76 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2h3Q8VD76 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2h3Q8VD76 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2h3Q8VD76 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2h3Q8VD76 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2h3Q8VD76 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2h3Q8VD76 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2h3Q8VD76 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2h3Q8VD76 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2h3Q8VD76 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2h3Q8VD76 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2h3Q8VD76 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2h3Q8VD76 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2h3Q8VD76 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2h3Q8VD76 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2h3Q8VD76 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2h3Q8VD76 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2h3Q8VD76 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2h3Q8VD76 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2h3Q8VD76 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2h3Q8VD76 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2h3Q8VD76 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2h3Q8VD76 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2h3Q8VD76 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2h3Q8VD76 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2h3Q8VD76 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2h3Q8VD76 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2h3Q8VD76 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2h3Q8VD76 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2h3Q8VD76 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2h3Q8VD76 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2h3Q8VD76 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2h3Q8VD76 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2h3Q8VD76 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2h3Q8VD76 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2h3Q8VD76 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2h3Q8VD76 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2h3Q8VD76 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2h3Q8VD76 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2h3Q8VD76 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2h3Q8VD76 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2h3Q8VD76 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2h3Q8VD76 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2h3Q8VD76 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2h3Q8VD76 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2h3Q8VD76 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2h3Q8VD76 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2h3Q8VD76 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2h3Q8VD76 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2h3Q8VD76 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2h3Q8VD76 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2h3Q8VD76 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2h3Q8VD76 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2h3Q8VD76 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2h3Q8VD76 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gtf2h3Q8VD76 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2h3Q8VD76 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2h3Q8VD76 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2h3Q8VD76 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2h3Q8VD76 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2h3Q8VD76 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2h3Q8VD76 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2h3Q8VD76 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2h3Q8VD76 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2h3Q8VD76 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2h3Q8VD76 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2h3Q8VD76 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2h3Q8VD76 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2h3Q8VD76 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2h3Q8VD76 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2h3Q8VD76 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2h3Q8VD76 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2h3Q8VD76 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2h3Q8VD76 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2h3Q8VD76 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2h3Q8VD76 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2h3Q8VD76 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2h3Q8VD76 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2h3Q8VD76 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms