Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk8Q8R3L8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk8Q8R3L8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk8Q8R3L8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdk8Q8R3L8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdk8Q8R3L8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdk8Q8R3L8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdk8Q8R3L8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdk8Q8R3L8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdk8Q8R3L8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdk8Q8R3L8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdk8Q8R3L8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdk8Q8R3L8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdk8Q8R3L8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdk8Q8R3L8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdk8Q8R3L8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdk8Q8R3L8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdk8Q8R3L8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdk8Q8R3L8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdk8Q8R3L8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdk8Q8R3L8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdk8Q8R3L8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdk8Q8R3L8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdk8Q8R3L8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdk8Q8R3L8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdk8Q8R3L8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdk8Q8R3L8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdk8Q8R3L8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdk8Q8R3L8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdk8Q8R3L8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdk8Q8R3L8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdk8Q8R3L8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdk8Q8R3L8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdk8Q8R3L8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdk8Q8R3L8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdk8Q8R3L8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdk8Q8R3L8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdk8Q8R3L8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdk8Q8R3L8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cdk8Q8R3L8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdk8Q8R3L8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdk8Q8R3L8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdk8Q8R3L8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdk8Q8R3L8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdk8Q8R3L8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdk8Q8R3L8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdk8Q8R3L8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdk8Q8R3L8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdk8Q8R3L8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdk8Q8R3L8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdk8Q8R3L8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdk8Q8R3L8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdk8Q8R3L8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdk8Q8R3L8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdk8Q8R3L8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdk8Q8R3L8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk8Q8R3L8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk8Q8R3L8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk8Q8R3L8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk8Q8R3L8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdk8Q8R3L8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdk8Q8R3L8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdk8Q8R3L8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdk8Q8R3L8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdk8Q8R3L8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdk8Q8R3L8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdk8Q8R3L8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdk8Q8R3L8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdk8Q8R3L8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdk8Q8R3L8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdk8Q8R3L8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdk8Q8R3L8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdk8Q8R3L8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdk8Q8R3L8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdk8Q8R3L8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdk8Q8R3L8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdk8Q8R3L8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdk8Q8R3L8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdk8Q8R3L8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdk8Q8R3L8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdk8Q8R3L8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdk8Q8R3L8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdk8Q8R3L8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdk8Q8R3L8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdk8Q8R3L8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdk8Q8R3L8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdk8Q8R3L8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdk8Q8R3L8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdk8Q8R3L8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk8Q8R3L8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk8Q8R3L8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk8Q8R3L8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk8Q8R3L8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk8Q8R3L8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdk8Q8R3L8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdk8Q8R3L8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdk8Q8R3L8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdk8Q8R3L8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cdk8Q8R3L8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cdk8Q8R3L8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms