Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg10Q8R1P4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg10Q8R1P4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg10Q8R1P4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg10Q8R1P4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg10Q8R1P4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg10Q8R1P4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg10Q8R1P4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg10Q8R1P4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg10Q8R1P4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg10Q8R1P4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg10Q8R1P4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg10Q8R1P4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg10Q8R1P4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg10Q8R1P4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg10Q8R1P4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg10Q8R1P4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg10Q8R1P4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg10Q8R1P4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg10Q8R1P4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg10Q8R1P4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg10Q8R1P4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg10Q8R1P4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg10Q8R1P4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg10Q8R1P4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg10Q8R1P4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg10Q8R1P4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg10Q8R1P4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg10Q8R1P4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg10Q8R1P4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg10Q8R1P4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg10Q8R1P4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg10Q8R1P4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg10Q8R1P4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg10Q8R1P4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg10Q8R1P4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg10Q8R1P4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg10Q8R1P4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg10Q8R1P4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg10Q8R1P4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg10Q8R1P4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg10Q8R1P4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg10Q8R1P4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg10Q8R1P4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg10Q8R1P4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg10Q8R1P4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg10Q8R1P4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg10Q8R1P4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg10Q8R1P4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg10Q8R1P4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg10Q8R1P4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg10Q8R1P4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg10Q8R1P4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg10Q8R1P4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atg10Q8R1P4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atg10Q8R1P4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atg10Q8R1P4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg10Q8R1P4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg10Q8R1P4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg10Q8R1P4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg10Q8R1P4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg10Q8R1P4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg10Q8R1P4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg10Q8R1P4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg10Q8R1P4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg10Q8R1P4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg10Q8R1P4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg10Q8R1P4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg10Q8R1P4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg10Q8R1P4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg10Q8R1P4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg10Q8R1P4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg10Q8R1P4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg10Q8R1P4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg10Q8R1P4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg10Q8R1P4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg10Q8R1P4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg10Q8R1P4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg10Q8R1P4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg10Q8R1P4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg10Q8R1P4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg10Q8R1P4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg10Q8R1P4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg10Q8R1P4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg10Q8R1P4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg10Q8R1P4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg10Q8R1P4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg10Q8R1P4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg10Q8R1P4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg10Q8R1P4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg10Q8R1P4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atg10Q8R1P4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg10Q8R1P4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg10Q8R1P4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg10Q8R1P4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg10Q8R1P4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg10Q8R1P4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg10Q8R1P4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg10Q8R1P4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg10Q8R1P4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms