Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sf3b4Q8QZY9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Sf3b4Q8QZY9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sf3b4Q8QZY9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sf3b4Q8QZY9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sf3b4Q8QZY9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sf3b4Q8QZY9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sf3b4Q8QZY9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sf3b4Q8QZY9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sf3b4Q8QZY9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sf3b4Q8QZY9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sf3b4Q8QZY9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sf3b4Q8QZY9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sf3b4Q8QZY9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sf3b4Q8QZY9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sf3b4Q8QZY9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sf3b4Q8QZY9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sf3b4Q8QZY9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sf3b4Q8QZY9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sf3b4Q8QZY9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sf3b4Q8QZY9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sf3b4Q8QZY9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Sf3b4Q8QZY9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sf3b4Q8QZY9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sf3b4Q8QZY9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sf3b4Q8QZY9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3b4Q8QZY9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3b4Q8QZY9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3b4Q8QZY9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3b4Q8QZY9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3b4Q8QZY9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3b4Q8QZY9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3b4Q8QZY9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3b4Q8QZY9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sf3b4Q8QZY9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sf3b4Q8QZY9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sf3b4Q8QZY9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sf3b4Q8QZY9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sf3b4Q8QZY9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3b4Q8QZY9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3b4Q8QZY9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3b4Q8QZY9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3b4Q8QZY9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3b4Q8QZY9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3b4Q8QZY9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3b4Q8QZY9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sf3b4Q8QZY9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sf3b4Q8QZY9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3b4Q8QZY9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3b4Q8QZY9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3b4Q8QZY9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3b4Q8QZY9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3b4Q8QZY9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sf3b4Q8QZY9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sf3b4Q8QZY9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sf3b4Q8QZY9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sf3b4Q8QZY9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sf3b4Q8QZY9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sf3b4Q8QZY9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sf3b4Q8QZY9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sf3b4Q8QZY9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sf3b4Q8QZY9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sf3b4Q8QZY9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sf3b4Q8QZY9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sf3b4Q8QZY9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sf3b4Q8QZY9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sf3b4Q8QZY9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sf3b4Q8QZY9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sf3b4Q8QZY9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sf3b4Q8QZY9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sf3b4Q8QZY9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sf3b4Q8QZY9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sf3b4Q8QZY9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sf3b4Q8QZY9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sf3b4Q8QZY9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sf3b4Q8QZY9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b4Q8QZY9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b4Q8QZY9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b4Q8QZY9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b4Q8QZY9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b4Q8QZY9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b4Q8QZY9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b4Q8QZY9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b4Q8QZY9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b4Q8QZY9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b4Q8QZY9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b4Q8QZY9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b4Q8QZY9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b4Q8QZY9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b4Q8QZY9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b4Q8QZY9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b4Q8QZY9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b4Q8QZY9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b4Q8QZY9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b4Q8QZY9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b4Q8QZY9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b4Q8QZY9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b4Q8QZY9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b4Q8QZY9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b4Q8QZY9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms