Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scara5Q8K299 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scara5Q8K299 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scara5Q8K299 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scara5Q8K299 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scara5Q8K299 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scara5Q8K299 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scara5Q8K299 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scara5Q8K299 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scara5Q8K299 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scara5Q8K299 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scara5Q8K299 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scara5Q8K299 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scara5Q8K299 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scara5Q8K299 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scara5Q8K299 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scara5Q8K299 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scara5Q8K299 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scara5Q8K299 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scara5Q8K299 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scara5Q8K299 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scara5Q8K299 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scara5Q8K299 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scara5Q8K299 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scara5Q8K299 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scara5Q8K299 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scara5Q8K299 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scara5Q8K299 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scara5Q8K299 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scara5Q8K299 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scara5Q8K299 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scara5Q8K299 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scara5Q8K299 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scara5Q8K299 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scara5Q8K299 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scara5Q8K299 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scara5Q8K299 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scara5Q8K299 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scara5Q8K299 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Scara5Q8K299 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scara5Q8K299 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scara5Q8K299 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scara5Q8K299 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scara5Q8K299 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Scara5Q8K299 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Scara5Q8K299 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scara5Q8K299 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scara5Q8K299 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scara5Q8K299 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scara5Q8K299 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scara5Q8K299 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scara5Q8K299 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scara5Q8K299 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scara5Q8K299 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scara5Q8K299 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scara5Q8K299 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scara5Q8K299 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scara5Q8K299 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scara5Q8K299 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Scara5Q8K299 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scara5Q8K299 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scara5Q8K299 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scara5Q8K299 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scara5Q8K299 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Scara5Q8K299 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scara5Q8K299 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scara5Q8K299 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scara5Q8K299 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scara5Q8K299 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scara5Q8K299 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scara5Q8K299 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scara5Q8K299 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scara5Q8K299 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scara5Q8K299 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scara5Q8K299 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scara5Q8K299 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scara5Q8K299 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Scara5Q8K299 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Scara5Q8K299 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scara5Q8K299 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Scara5Q8K299 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scara5Q8K299 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scara5Q8K299 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scara5Q8K299 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scara5Q8K299 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scara5Q8K299 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scara5Q8K299 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scara5Q8K299 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scara5Q8K299 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scara5Q8K299 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scara5Q8K299 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Scara5Q8K299 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scara5Q8K299 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scara5Q8K299 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scara5Q8K299 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scara5Q8K299 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scara5Q8K299 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scara5Q8K299 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scara5Q8K299 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scara5Q8K299 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms