Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0D5

Gfm1, Elongation factor G, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfm1Q8K0D5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gfm1Q8K0D5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gfm1Q8K0D5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gfm1Q8K0D5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gfm1Q8K0D5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gfm1Q8K0D5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gfm1Q8K0D5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gfm1Q8K0D5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gfm1Q8K0D5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gfm1Q8K0D5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gfm1Q8K0D5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gfm1Q8K0D5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gfm1Q8K0D5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gfm1Q8K0D5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gfm1Q8K0D5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gfm1Q8K0D5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gfm1Q8K0D5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gfm1Q8K0D5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gfm1Q8K0D5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gfm1Q8K0D5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gfm1Q8K0D5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gfm1Q8K0D5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gfm1Q8K0D5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gfm1Q8K0D5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gfm1Q8K0D5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gfm1Q8K0D5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gfm1Q8K0D5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gfm1Q8K0D5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gfm1Q8K0D5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gfm1Q8K0D5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gfm1Q8K0D5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gfm1Q8K0D5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gfm1Q8K0D5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gfm1Q8K0D5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gfm1Q8K0D5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gfm1Q8K0D5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gfm1Q8K0D5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gfm1Q8K0D5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gfm1Q8K0D5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gfm1Q8K0D5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gfm1Q8K0D5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gfm1Q8K0D5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gfm1Q8K0D5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gfm1Q8K0D5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gfm1Q8K0D5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gfm1Q8K0D5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gfm1Q8K0D5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gfm1Q8K0D5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gfm1Q8K0D5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gfm1Q8K0D5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gfm1Q8K0D5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gfm1Q8K0D5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gfm1Q8K0D5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gfm1Q8K0D5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gfm1Q8K0D5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gfm1Q8K0D5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gfm1Q8K0D5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gfm1Q8K0D5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gfm1Q8K0D5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gfm1Q8K0D5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gfm1Q8K0D5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gfm1Q8K0D5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gfm1Q8K0D5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gfm1Q8K0D5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gfm1Q8K0D5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gfm1Q8K0D5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gfm1Q8K0D5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gfm1Q8K0D5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gfm1Q8K0D5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gfm1Q8K0D5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gfm1Q8K0D5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gfm1Q8K0D5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gfm1Q8K0D5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gfm1Q8K0D5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gfm1Q8K0D5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gfm1Q8K0D5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gfm1Q8K0D5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gfm1Q8K0D5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gfm1Q8K0D5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gfm1Q8K0D5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gfm1Q8K0D5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gfm1Q8K0D5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gfm1Q8K0D5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gfm1Q8K0D5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gfm1Q8K0D5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gfm1Q8K0D5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gfm1Q8K0D5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gfm1Q8K0D5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gfm1Q8K0D5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gfm1Q8K0D5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gfm1Q8K0D5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gfm1Q8K0D5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gfm1Q8K0D5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gfm1Q8K0D5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gfm1Q8K0D5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gfm1Q8K0D5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gfm1Q8K0D5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gfm1Q8K0D5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gfm1Q8K0D5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gfm1Q8K0D5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms