Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mterf1aQ8CHZ9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mterf1aQ8CHZ9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mterf1aQ8CHZ9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mterf1aQ8CHZ9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mterf1aQ8CHZ9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mterf1aQ8CHZ9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mterf1aQ8CHZ9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mterf1aQ8CHZ9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mterf1aQ8CHZ9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mterf1aQ8CHZ9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mterf1aQ8CHZ9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Mterf1aQ8CHZ9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Mterf1aQ8CHZ9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mterf1aQ8CHZ9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mterf1aQ8CHZ9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mterf1aQ8CHZ9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mterf1aQ8CHZ9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mterf1aQ8CHZ9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mterf1aQ8CHZ9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mterf1aQ8CHZ9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mterf1aQ8CHZ9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mterf1aQ8CHZ9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mterf1aQ8CHZ9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mterf1aQ8CHZ9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mterf1aQ8CHZ9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mterf1aQ8CHZ9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mterf1aQ8CHZ9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mterf1aQ8CHZ9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mterf1aQ8CHZ9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mterf1aQ8CHZ9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mterf1aQ8CHZ9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mterf1aQ8CHZ9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mterf1aQ8CHZ9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mterf1aQ8CHZ9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mterf1aQ8CHZ9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mterf1aQ8CHZ9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mterf1aQ8CHZ9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mterf1aQ8CHZ9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mterf1aQ8CHZ9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Mterf1aQ8CHZ9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mterf1aQ8CHZ9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mterf1aQ8CHZ9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mterf1aQ8CHZ9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mterf1aQ8CHZ9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mterf1aQ8CHZ9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mterf1aQ8CHZ9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mterf1aQ8CHZ9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mterf1aQ8CHZ9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mterf1aQ8CHZ9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mterf1aQ8CHZ9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mterf1aQ8CHZ9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mterf1aQ8CHZ9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mterf1aQ8CHZ9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mterf1aQ8CHZ9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mterf1aQ8CHZ9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mterf1aQ8CHZ9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mterf1aQ8CHZ9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mterf1aQ8CHZ9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mterf1aQ8CHZ9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mterf1aQ8CHZ9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mterf1aQ8CHZ9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mterf1aQ8CHZ9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mterf1aQ8CHZ9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mterf1aQ8CHZ9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mterf1aQ8CHZ9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mterf1aQ8CHZ9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mterf1aQ8CHZ9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Mterf1aQ8CHZ9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mterf1aQ8CHZ9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mterf1aQ8CHZ9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mterf1aQ8CHZ9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mterf1aQ8CHZ9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mterf1aQ8CHZ9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Mterf1aQ8CHZ9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mterf1aQ8CHZ9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mterf1aQ8CHZ9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mterf1aQ8CHZ9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mterf1aQ8CHZ9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mterf1aQ8CHZ9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mterf1aQ8CHZ9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mterf1aQ8CHZ9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mterf1aQ8CHZ9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mterf1aQ8CHZ9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mterf1aQ8CHZ9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mterf1aQ8CHZ9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mterf1aQ8CHZ9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mterf1aQ8CHZ9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mterf1aQ8CHZ9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mterf1aQ8CHZ9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Mterf1aQ8CHZ9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Mterf1aQ8CHZ9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mterf1aQ8CHZ9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mterf1aQ8CHZ9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mterf1aQ8CHZ9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms