Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Lrrc9Q8CDN9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Lrrc9Q8CDN9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Lrrc9Q8CDN9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Lrrc9Q8CDN9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Lrrc9Q8CDN9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Lrrc9Q8CDN9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Lrrc9Q8CDN9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Lrrc9Q8CDN9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Lrrc9Q8CDN9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Lrrc9Q8CDN9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Lrrc9Q8CDN9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
Lrrc9Q8CDN9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Lrrc9Q8CDN9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Lrrc9Q8CDN9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Lrrc9Q8CDN9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Lrrc9Q8CDN9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Lrrc9Q8CDN9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
Lrrc9Q8CDN9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Lrrc9Q8CDN9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Lrrc9Q8CDN9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Lrrc9Q8CDN9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Lrrc9Q8CDN9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Lrrc9Q8CDN9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Lrrc9Q8CDN9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Lrrc9Q8CDN9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Lrrc9Q8CDN9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Lrrc9Q8CDN9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Lrrc9Q8CDN9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Lrrc9Q8CDN9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Lrrc9Q8CDN9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Lrrc9Q8CDN9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.02
Lrrc9Q8CDN9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Lrrc9Q8CDN9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Lrrc9Q8CDN9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Lrrc9Q8CDN9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Lrrc9Q8CDN9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Lrrc9Q8CDN9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Lrrc9Q8CDN9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Lrrc9Q8CDN9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Lrrc9Q8CDN9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Lrrc9Q8CDN9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Lrrc9Q8CDN9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Lrrc9Q8CDN9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Lrrc9Q8CDN9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Lrrc9Q8CDN9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Lrrc9Q8CDN9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Lrrc9Q8CDN9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Lrrc9Q8CDN9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Lrrc9Q8CDN9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Lrrc9Q8CDN9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Lrrc9Q8CDN9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Lrrc9Q8CDN9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Lrrc9Q8CDN9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Lrrc9Q8CDN9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Lrrc9Q8CDN9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Lrrc9Q8CDN9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Lrrc9Q8CDN9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Lrrc9Q8CDN9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Lrrc9Q8CDN9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Lrrc9Q8CDN9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Lrrc9Q8CDN9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Lrrc9Q8CDN9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Lrrc9Q8CDN9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Lrrc9Q8CDN9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Lrrc9Q8CDN9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Lrrc9Q8CDN9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Lrrc9Q8CDN9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Lrrc9Q8CDN9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Lrrc9Q8CDN9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Lrrc9Q8CDN9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Lrrc9Q8CDN9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Lrrc9Q8CDN9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Lrrc9Q8CDN9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Lrrc9Q8CDN9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Lrrc9Q8CDN9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Lrrc9Q8CDN9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
Lrrc9Q8CDN9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Lrrc9Q8CDN9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Lrrc9Q8CDN9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Lrrc9Q8CDN9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
Lrrc9Q8CDN9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
Lrrc9Q8CDN9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Lrrc9Q8CDN9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Lrrc9Q8CDN9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Lrrc9Q8CDN9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Lrrc9Q8CDN9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Lrrc9Q8CDN9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Lrrc9Q8CDN9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Lrrc9Q8CDN9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Lrrc9Q8CDN9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Lrrc9Q8CDN9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Lrrc9Q8CDN9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Lrrc9Q8CDN9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Lrrc9Q8CDN9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Lrrc9Q8CDN9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Lrrc9Q8CDN9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Lrrc9Q8CDN9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
Lrrc9Q8CDN9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
Lrrc9Q8CDN9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC33.76■■■■□ 3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms