Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN1

Uncharacterized protein C3orf20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CDN1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q8CDN1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Q8CDN1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q8CDN1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q8CDN1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q8CDN1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q8CDN1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q8CDN1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q8CDN1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q8CDN1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q8CDN1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q8CDN1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q8CDN1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q8CDN1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q8CDN1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q8CDN1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q8CDN1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q8CDN1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q8CDN1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q8CDN1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q8CDN1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q8CDN1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q8CDN1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q8CDN1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q8CDN1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q8CDN1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q8CDN1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q8CDN1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q8CDN1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q8CDN1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q8CDN1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q8CDN1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q8CDN1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q8CDN1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q8CDN1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q8CDN1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q8CDN1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q8CDN1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q8CDN1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q8CDN1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Q8CDN1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q8CDN1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q8CDN1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q8CDN1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q8CDN1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q8CDN1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Q8CDN1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q8CDN1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q8CDN1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q8CDN1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q8CDN1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q8CDN1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q8CDN1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q8CDN1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q8CDN1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Q8CDN1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q8CDN1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q8CDN1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Q8CDN1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q8CDN1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q8CDN1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q8CDN1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q8CDN1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q8CDN1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q8CDN1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q8CDN1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q8CDN1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q8CDN1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8CDN1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8CDN1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8CDN1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8CDN1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8CDN1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8CDN1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8CDN1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8CDN1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8CDN1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8CDN1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8CDN1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8CDN1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q8CDN1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q8CDN1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q8CDN1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q8CDN1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q8CDN1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8CDN1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8CDN1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8CDN1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8CDN1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8CDN1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8CDN1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8CDN1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8CDN1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8CDN1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q8CDN1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q8CDN1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q8CDN1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q8CDN1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8CDN1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8CDN1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms