Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9M2

Ccdc15, Coiled-coil domain-containing protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc15Q8C9M2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc15Q8C9M2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc15Q8C9M2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc15Q8C9M2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc15Q8C9M2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc15Q8C9M2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc15Q8C9M2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc15Q8C9M2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc15Q8C9M2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc15Q8C9M2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc15Q8C9M2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc15Q8C9M2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc15Q8C9M2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc15Q8C9M2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc15Q8C9M2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc15Q8C9M2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc15Q8C9M2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc15Q8C9M2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc15Q8C9M2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc15Q8C9M2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc15Q8C9M2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc15Q8C9M2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc15Q8C9M2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms