Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dclre1bQ8C7W7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Dclre1bQ8C7W7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dclre1bQ8C7W7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dclre1bQ8C7W7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dclre1bQ8C7W7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dclre1bQ8C7W7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dclre1bQ8C7W7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dclre1bQ8C7W7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dclre1bQ8C7W7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dclre1bQ8C7W7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dclre1bQ8C7W7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dclre1bQ8C7W7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dclre1bQ8C7W7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dclre1bQ8C7W7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dclre1bQ8C7W7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Dclre1bQ8C7W7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dclre1bQ8C7W7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dclre1bQ8C7W7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dclre1bQ8C7W7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dclre1bQ8C7W7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dclre1bQ8C7W7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dclre1bQ8C7W7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dclre1bQ8C7W7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dclre1bQ8C7W7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dclre1bQ8C7W7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dclre1bQ8C7W7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dclre1bQ8C7W7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dclre1bQ8C7W7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dclre1bQ8C7W7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dclre1bQ8C7W7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dclre1bQ8C7W7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dclre1bQ8C7W7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dclre1bQ8C7W7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dclre1bQ8C7W7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dclre1bQ8C7W7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dclre1bQ8C7W7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dclre1bQ8C7W7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dclre1bQ8C7W7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dclre1bQ8C7W7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dclre1bQ8C7W7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dclre1bQ8C7W7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dclre1bQ8C7W7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Dclre1bQ8C7W7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dclre1bQ8C7W7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dclre1bQ8C7W7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Dclre1bQ8C7W7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dclre1bQ8C7W7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dclre1bQ8C7W7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dclre1bQ8C7W7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dclre1bQ8C7W7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dclre1bQ8C7W7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dclre1bQ8C7W7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dclre1bQ8C7W7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dclre1bQ8C7W7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Dclre1bQ8C7W7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Dclre1bQ8C7W7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dclre1bQ8C7W7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Dclre1bQ8C7W7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dclre1bQ8C7W7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dclre1bQ8C7W7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Dclre1bQ8C7W7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dclre1bQ8C7W7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dclre1bQ8C7W7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dclre1bQ8C7W7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dclre1bQ8C7W7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dclre1bQ8C7W7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dclre1bQ8C7W7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dclre1bQ8C7W7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dclre1bQ8C7W7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dclre1bQ8C7W7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dclre1bQ8C7W7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dclre1bQ8C7W7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dclre1bQ8C7W7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dclre1bQ8C7W7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dclre1bQ8C7W7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dclre1bQ8C7W7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dclre1bQ8C7W7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dclre1bQ8C7W7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dclre1bQ8C7W7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dclre1bQ8C7W7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Dclre1bQ8C7W7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dclre1bQ8C7W7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dclre1bQ8C7W7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dclre1bQ8C7W7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dclre1bQ8C7W7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dclre1bQ8C7W7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dclre1bQ8C7W7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dclre1bQ8C7W7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dclre1bQ8C7W7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dclre1bQ8C7W7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dclre1bQ8C7W7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dclre1bQ8C7W7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dclre1bQ8C7W7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dclre1bQ8C7W7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dclre1bQ8C7W7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dclre1bQ8C7W7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dclre1bQ8C7W7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dclre1bQ8C7W7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dclre1bQ8C7W7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms