Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN3

Catsper4, Cation channel sperm-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper4Q8BVN3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Catsper4Q8BVN3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Catsper4Q8BVN3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Catsper4Q8BVN3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Catsper4Q8BVN3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Catsper4Q8BVN3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Catsper4Q8BVN3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Catsper4Q8BVN3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Catsper4Q8BVN3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Catsper4Q8BVN3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Catsper4Q8BVN3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Catsper4Q8BVN3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Catsper4Q8BVN3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Catsper4Q8BVN3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Catsper4Q8BVN3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Catsper4Q8BVN3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Catsper4Q8BVN3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Catsper4Q8BVN3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Catsper4Q8BVN3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Catsper4Q8BVN3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Catsper4Q8BVN3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Catsper4Q8BVN3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Catsper4Q8BVN3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Catsper4Q8BVN3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Catsper4Q8BVN3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Catsper4Q8BVN3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Catsper4Q8BVN3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Catsper4Q8BVN3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Catsper4Q8BVN3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Catsper4Q8BVN3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Catsper4Q8BVN3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Catsper4Q8BVN3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Catsper4Q8BVN3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Catsper4Q8BVN3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Catsper4Q8BVN3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Catsper4Q8BVN3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Catsper4Q8BVN3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Catsper4Q8BVN3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Catsper4Q8BVN3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Catsper4Q8BVN3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Catsper4Q8BVN3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Catsper4Q8BVN3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Catsper4Q8BVN3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Catsper4Q8BVN3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Catsper4Q8BVN3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Catsper4Q8BVN3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Catsper4Q8BVN3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Catsper4Q8BVN3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Catsper4Q8BVN3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Catsper4Q8BVN3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Catsper4Q8BVN3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Catsper4Q8BVN3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Catsper4Q8BVN3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Catsper4Q8BVN3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Catsper4Q8BVN3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Catsper4Q8BVN3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Catsper4Q8BVN3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Catsper4Q8BVN3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Catsper4Q8BVN3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Catsper4Q8BVN3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Catsper4Q8BVN3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Catsper4Q8BVN3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Catsper4Q8BVN3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Catsper4Q8BVN3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Catsper4Q8BVN3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Catsper4Q8BVN3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Catsper4Q8BVN3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Catsper4Q8BVN3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Catsper4Q8BVN3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Catsper4Q8BVN3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Catsper4Q8BVN3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Catsper4Q8BVN3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Catsper4Q8BVN3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Catsper4Q8BVN3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Catsper4Q8BVN3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Catsper4Q8BVN3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Catsper4Q8BVN3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Catsper4Q8BVN3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Catsper4Q8BVN3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Catsper4Q8BVN3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Catsper4Q8BVN3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Catsper4Q8BVN3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Catsper4Q8BVN3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Catsper4Q8BVN3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Catsper4Q8BVN3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Catsper4Q8BVN3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Catsper4Q8BVN3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Catsper4Q8BVN3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Catsper4Q8BVN3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Catsper4Q8BVN3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Catsper4Q8BVN3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Catsper4Q8BVN3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Catsper4Q8BVN3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Catsper4Q8BVN3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Catsper4Q8BVN3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Catsper4Q8BVN3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Catsper4Q8BVN3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Catsper4Q8BVN3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Catsper4Q8BVN3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Catsper4Q8BVN3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.4 ms