Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lmod1Q8BVA4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lmod1Q8BVA4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lmod1Q8BVA4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lmod1Q8BVA4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lmod1Q8BVA4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lmod1Q8BVA4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lmod1Q8BVA4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lmod1Q8BVA4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lmod1Q8BVA4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lmod1Q8BVA4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lmod1Q8BVA4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lmod1Q8BVA4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lmod1Q8BVA4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lmod1Q8BVA4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lmod1Q8BVA4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lmod1Q8BVA4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lmod1Q8BVA4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lmod1Q8BVA4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lmod1Q8BVA4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lmod1Q8BVA4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lmod1Q8BVA4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lmod1Q8BVA4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lmod1Q8BVA4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lmod1Q8BVA4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lmod1Q8BVA4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lmod1Q8BVA4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lmod1Q8BVA4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lmod1Q8BVA4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lmod1Q8BVA4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lmod1Q8BVA4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lmod1Q8BVA4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lmod1Q8BVA4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lmod1Q8BVA4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lmod1Q8BVA4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lmod1Q8BVA4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lmod1Q8BVA4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Lmod1Q8BVA4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lmod1Q8BVA4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lmod1Q8BVA4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lmod1Q8BVA4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lmod1Q8BVA4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lmod1Q8BVA4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lmod1Q8BVA4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Lmod1Q8BVA4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lmod1Q8BVA4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lmod1Q8BVA4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lmod1Q8BVA4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lmod1Q8BVA4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lmod1Q8BVA4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lmod1Q8BVA4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Lmod1Q8BVA4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lmod1Q8BVA4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Lmod1Q8BVA4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lmod1Q8BVA4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lmod1Q8BVA4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lmod1Q8BVA4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lmod1Q8BVA4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lmod1Q8BVA4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lmod1Q8BVA4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lmod1Q8BVA4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lmod1Q8BVA4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lmod1Q8BVA4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lmod1Q8BVA4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lmod1Q8BVA4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lmod1Q8BVA4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lmod1Q8BVA4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lmod1Q8BVA4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lmod1Q8BVA4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lmod1Q8BVA4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lmod1Q8BVA4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lmod1Q8BVA4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lmod1Q8BVA4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Lmod1Q8BVA4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lmod1Q8BVA4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Lmod1Q8BVA4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lmod1Q8BVA4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lmod1Q8BVA4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Lmod1Q8BVA4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lmod1Q8BVA4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lmod1Q8BVA4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lmod1Q8BVA4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lmod1Q8BVA4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lmod1Q8BVA4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Lmod1Q8BVA4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lmod1Q8BVA4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lmod1Q8BVA4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lmod1Q8BVA4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lmod1Q8BVA4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Lmod1Q8BVA4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lmod1Q8BVA4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lmod1Q8BVA4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lmod1Q8BVA4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lmod1Q8BVA4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lmod1Q8BVA4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lmod1Q8BVA4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lmod1Q8BVA4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lmod1Q8BVA4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lmod1Q8BVA4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lmod1Q8BVA4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms