Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRN9

Cc2d1b, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d1bQ8BRN9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cc2d1bQ8BRN9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cc2d1bQ8BRN9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cc2d1bQ8BRN9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cc2d1bQ8BRN9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cc2d1bQ8BRN9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cc2d1bQ8BRN9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cc2d1bQ8BRN9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cc2d1bQ8BRN9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cc2d1bQ8BRN9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cc2d1bQ8BRN9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cc2d1bQ8BRN9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cc2d1bQ8BRN9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cc2d1bQ8BRN9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cc2d1bQ8BRN9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cc2d1bQ8BRN9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cc2d1bQ8BRN9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cc2d1bQ8BRN9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cc2d1bQ8BRN9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cc2d1bQ8BRN9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cc2d1bQ8BRN9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cc2d1bQ8BRN9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cc2d1bQ8BRN9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cc2d1bQ8BRN9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cc2d1bQ8BRN9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cc2d1bQ8BRN9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cc2d1bQ8BRN9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cc2d1bQ8BRN9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cc2d1bQ8BRN9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cc2d1bQ8BRN9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cc2d1bQ8BRN9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cc2d1bQ8BRN9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cc2d1bQ8BRN9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cc2d1bQ8BRN9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cc2d1bQ8BRN9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cc2d1bQ8BRN9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cc2d1bQ8BRN9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cc2d1bQ8BRN9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cc2d1bQ8BRN9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cc2d1bQ8BRN9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cc2d1bQ8BRN9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cc2d1bQ8BRN9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cc2d1bQ8BRN9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cc2d1bQ8BRN9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cc2d1bQ8BRN9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cc2d1bQ8BRN9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cc2d1bQ8BRN9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cc2d1bQ8BRN9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cc2d1bQ8BRN9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cc2d1bQ8BRN9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cc2d1bQ8BRN9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cc2d1bQ8BRN9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cc2d1bQ8BRN9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cc2d1bQ8BRN9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cc2d1bQ8BRN9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cc2d1bQ8BRN9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cc2d1bQ8BRN9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cc2d1bQ8BRN9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cc2d1bQ8BRN9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cc2d1bQ8BRN9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cc2d1bQ8BRN9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cc2d1bQ8BRN9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cc2d1bQ8BRN9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cc2d1bQ8BRN9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cc2d1bQ8BRN9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cc2d1bQ8BRN9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cc2d1bQ8BRN9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cc2d1bQ8BRN9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cc2d1bQ8BRN9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cc2d1bQ8BRN9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cc2d1bQ8BRN9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cc2d1bQ8BRN9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cc2d1bQ8BRN9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cc2d1bQ8BRN9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cc2d1bQ8BRN9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cc2d1bQ8BRN9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cc2d1bQ8BRN9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cc2d1bQ8BRN9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cc2d1bQ8BRN9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cc2d1bQ8BRN9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cc2d1bQ8BRN9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cc2d1bQ8BRN9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cc2d1bQ8BRN9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cc2d1bQ8BRN9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cc2d1bQ8BRN9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cc2d1bQ8BRN9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cc2d1bQ8BRN9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cc2d1bQ8BRN9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cc2d1bQ8BRN9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cc2d1bQ8BRN9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cc2d1bQ8BRN9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cc2d1bQ8BRN9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cc2d1bQ8BRN9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cc2d1bQ8BRN9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cc2d1bQ8BRN9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Cc2d1bQ8BRN9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cc2d1bQ8BRN9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cc2d1bQ8BRN9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cc2d1bQ8BRN9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Cc2d1bQ8BRN9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms