Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMP6

Acbd3, Golgi resident protein GCP60, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acbd3Q8BMP6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Acbd3Q8BMP6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Acbd3Q8BMP6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Acbd3Q8BMP6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Acbd3Q8BMP6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Acbd3Q8BMP6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Acbd3Q8BMP6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Acbd3Q8BMP6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Acbd3Q8BMP6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Acbd3Q8BMP6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Acbd3Q8BMP6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Acbd3Q8BMP6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Acbd3Q8BMP6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Acbd3Q8BMP6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Acbd3Q8BMP6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Acbd3Q8BMP6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Acbd3Q8BMP6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Acbd3Q8BMP6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Acbd3Q8BMP6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Acbd3Q8BMP6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Acbd3Q8BMP6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Acbd3Q8BMP6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Acbd3Q8BMP6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Acbd3Q8BMP6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Acbd3Q8BMP6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acbd3Q8BMP6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acbd3Q8BMP6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acbd3Q8BMP6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acbd3Q8BMP6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acbd3Q8BMP6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acbd3Q8BMP6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acbd3Q8BMP6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acbd3Q8BMP6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Acbd3Q8BMP6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acbd3Q8BMP6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acbd3Q8BMP6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Acbd3Q8BMP6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Acbd3Q8BMP6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Acbd3Q8BMP6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Acbd3Q8BMP6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Acbd3Q8BMP6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Acbd3Q8BMP6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Acbd3Q8BMP6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Acbd3Q8BMP6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Acbd3Q8BMP6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Acbd3Q8BMP6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Acbd3Q8BMP6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Acbd3Q8BMP6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Acbd3Q8BMP6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Acbd3Q8BMP6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Acbd3Q8BMP6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Acbd3Q8BMP6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Acbd3Q8BMP6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Acbd3Q8BMP6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Acbd3Q8BMP6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Acbd3Q8BMP6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Acbd3Q8BMP6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Acbd3Q8BMP6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Acbd3Q8BMP6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Acbd3Q8BMP6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Acbd3Q8BMP6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Acbd3Q8BMP6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Acbd3Q8BMP6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Acbd3Q8BMP6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Acbd3Q8BMP6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Acbd3Q8BMP6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Acbd3Q8BMP6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Acbd3Q8BMP6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Acbd3Q8BMP6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Acbd3Q8BMP6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Acbd3Q8BMP6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Acbd3Q8BMP6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Acbd3Q8BMP6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Acbd3Q8BMP6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Acbd3Q8BMP6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Acbd3Q8BMP6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Acbd3Q8BMP6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Acbd3Q8BMP6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Acbd3Q8BMP6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Acbd3Q8BMP6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Acbd3Q8BMP6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Acbd3Q8BMP6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Acbd3Q8BMP6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Acbd3Q8BMP6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Acbd3Q8BMP6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Acbd3Q8BMP6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Acbd3Q8BMP6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Acbd3Q8BMP6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Acbd3Q8BMP6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Acbd3Q8BMP6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Acbd3Q8BMP6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Acbd3Q8BMP6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Acbd3Q8BMP6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Acbd3Q8BMP6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Acbd3Q8BMP6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Acbd3Q8BMP6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Acbd3Q8BMP6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Acbd3Q8BMP6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Acbd3Q8BMP6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Acbd3Q8BMP6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms