Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLA8

Trpa1, Transient receptor potential cation channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpa1Q8BLA8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpa1Q8BLA8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpa1Q8BLA8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpa1Q8BLA8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpa1Q8BLA8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpa1Q8BLA8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpa1Q8BLA8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpa1Q8BLA8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpa1Q8BLA8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpa1Q8BLA8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpa1Q8BLA8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpa1Q8BLA8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpa1Q8BLA8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpa1Q8BLA8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpa1Q8BLA8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpa1Q8BLA8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpa1Q8BLA8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpa1Q8BLA8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpa1Q8BLA8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpa1Q8BLA8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpa1Q8BLA8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpa1Q8BLA8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpa1Q8BLA8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpa1Q8BLA8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpa1Q8BLA8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trpa1Q8BLA8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trpa1Q8BLA8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trpa1Q8BLA8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trpa1Q8BLA8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trpa1Q8BLA8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trpa1Q8BLA8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trpa1Q8BLA8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trpa1Q8BLA8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trpa1Q8BLA8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trpa1Q8BLA8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trpa1Q8BLA8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpa1Q8BLA8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpa1Q8BLA8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpa1Q8BLA8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpa1Q8BLA8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpa1Q8BLA8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpa1Q8BLA8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpa1Q8BLA8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpa1Q8BLA8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpa1Q8BLA8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpa1Q8BLA8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpa1Q8BLA8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpa1Q8BLA8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpa1Q8BLA8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpa1Q8BLA8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpa1Q8BLA8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpa1Q8BLA8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpa1Q8BLA8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpa1Q8BLA8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpa1Q8BLA8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpa1Q8BLA8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpa1Q8BLA8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpa1Q8BLA8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpa1Q8BLA8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpa1Q8BLA8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpa1Q8BLA8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpa1Q8BLA8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpa1Q8BLA8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpa1Q8BLA8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpa1Q8BLA8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpa1Q8BLA8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpa1Q8BLA8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpa1Q8BLA8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpa1Q8BLA8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpa1Q8BLA8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpa1Q8BLA8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpa1Q8BLA8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpa1Q8BLA8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpa1Q8BLA8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpa1Q8BLA8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpa1Q8BLA8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpa1Q8BLA8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpa1Q8BLA8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpa1Q8BLA8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpa1Q8BLA8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpa1Q8BLA8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpa1Q8BLA8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpa1Q8BLA8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpa1Q8BLA8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpa1Q8BLA8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpa1Q8BLA8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpa1Q8BLA8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpa1Q8BLA8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpa1Q8BLA8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpa1Q8BLA8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpa1Q8BLA8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpa1Q8BLA8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpa1Q8BLA8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpa1Q8BLA8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpa1Q8BLA8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Trpa1Q8BLA8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpa1Q8BLA8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpa1Q8BLA8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpa1Q8BLA8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpa1Q8BLA8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms