Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV0

Spock3, Testican-3, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock3Q8BKV0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Spock3Q8BKV0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spock3Q8BKV0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spock3Q8BKV0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spock3Q8BKV0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spock3Q8BKV0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spock3Q8BKV0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spock3Q8BKV0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spock3Q8BKV0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spock3Q8BKV0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spock3Q8BKV0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spock3Q8BKV0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spock3Q8BKV0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spock3Q8BKV0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spock3Q8BKV0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spock3Q8BKV0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Spock3Q8BKV0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Spock3Q8BKV0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Spock3Q8BKV0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spock3Q8BKV0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spock3Q8BKV0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spock3Q8BKV0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spock3Q8BKV0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spock3Q8BKV0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spock3Q8BKV0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spock3Q8BKV0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spock3Q8BKV0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spock3Q8BKV0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spock3Q8BKV0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Spock3Q8BKV0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spock3Q8BKV0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spock3Q8BKV0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spock3Q8BKV0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spock3Q8BKV0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spock3Q8BKV0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spock3Q8BKV0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spock3Q8BKV0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spock3Q8BKV0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spock3Q8BKV0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spock3Q8BKV0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spock3Q8BKV0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spock3Q8BKV0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Spock3Q8BKV0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Spock3Q8BKV0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spock3Q8BKV0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spock3Q8BKV0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spock3Q8BKV0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spock3Q8BKV0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spock3Q8BKV0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spock3Q8BKV0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spock3Q8BKV0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spock3Q8BKV0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spock3Q8BKV0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spock3Q8BKV0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spock3Q8BKV0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spock3Q8BKV0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Spock3Q8BKV0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spock3Q8BKV0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spock3Q8BKV0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spock3Q8BKV0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spock3Q8BKV0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spock3Q8BKV0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spock3Q8BKV0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spock3Q8BKV0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spock3Q8BKV0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 190.6 ms