Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW1

Fto, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase FTO, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FtoQ8BGW1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FtoQ8BGW1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FtoQ8BGW1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FtoQ8BGW1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FtoQ8BGW1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FtoQ8BGW1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FtoQ8BGW1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FtoQ8BGW1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FtoQ8BGW1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FtoQ8BGW1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FtoQ8BGW1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FtoQ8BGW1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FtoQ8BGW1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FtoQ8BGW1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FtoQ8BGW1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FtoQ8BGW1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FtoQ8BGW1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FtoQ8BGW1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FtoQ8BGW1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FtoQ8BGW1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FtoQ8BGW1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FtoQ8BGW1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FtoQ8BGW1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FtoQ8BGW1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FtoQ8BGW1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FtoQ8BGW1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FtoQ8BGW1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FtoQ8BGW1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FtoQ8BGW1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FtoQ8BGW1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FtoQ8BGW1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FtoQ8BGW1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FtoQ8BGW1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FtoQ8BGW1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FtoQ8BGW1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FtoQ8BGW1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FtoQ8BGW1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FtoQ8BGW1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FtoQ8BGW1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FtoQ8BGW1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FtoQ8BGW1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FtoQ8BGW1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FtoQ8BGW1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FtoQ8BGW1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FtoQ8BGW1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FtoQ8BGW1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FtoQ8BGW1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FtoQ8BGW1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
FtoQ8BGW1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FtoQ8BGW1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FtoQ8BGW1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FtoQ8BGW1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FtoQ8BGW1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FtoQ8BGW1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FtoQ8BGW1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FtoQ8BGW1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FtoQ8BGW1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FtoQ8BGW1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FtoQ8BGW1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FtoQ8BGW1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FtoQ8BGW1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FtoQ8BGW1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FtoQ8BGW1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FtoQ8BGW1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FtoQ8BGW1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FtoQ8BGW1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FtoQ8BGW1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FtoQ8BGW1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FtoQ8BGW1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FtoQ8BGW1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FtoQ8BGW1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FtoQ8BGW1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FtoQ8BGW1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FtoQ8BGW1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FtoQ8BGW1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FtoQ8BGW1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FtoQ8BGW1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FtoQ8BGW1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FtoQ8BGW1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FtoQ8BGW1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FtoQ8BGW1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FtoQ8BGW1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FtoQ8BGW1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FtoQ8BGW1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FtoQ8BGW1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FtoQ8BGW1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FtoQ8BGW1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FtoQ8BGW1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FtoQ8BGW1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FtoQ8BGW1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FtoQ8BGW1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FtoQ8BGW1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FtoQ8BGW1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FtoQ8BGW1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FtoQ8BGW1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FtoQ8BGW1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FtoQ8BGW1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FtoQ8BGW1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FtoQ8BGW1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FtoQ8BGW1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.8 ms