Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q8BGC1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q8BGC1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q8BGC1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q8BGC1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q8BGC1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q8BGC1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q8BGC1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q8BGC1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q8BGC1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q8BGC1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q8BGC1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Q8BGC1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q8BGC1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q8BGC1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Q8BGC1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q8BGC1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q8BGC1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q8BGC1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q8BGC1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q8BGC1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q8BGC1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Q8BGC1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q8BGC1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q8BGC1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q8BGC1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q8BGC1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q8BGC1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q8BGC1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q8BGC1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q8BGC1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q8BGC1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q8BGC1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q8BGC1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q8BGC1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q8BGC1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q8BGC1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q8BGC1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q8BGC1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q8BGC1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q8BGC1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q8BGC1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q8BGC1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q8BGC1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q8BGC1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Q8BGC1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Q8BGC1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q8BGC1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q8BGC1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q8BGC1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q8BGC1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q8BGC1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q8BGC1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q8BGC1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q8BGC1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q8BGC1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Q8BGC1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q8BGC1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Q8BGC1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q8BGC1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q8BGC1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Q8BGC1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q8BGC1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Q8BGC1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q8BGC1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q8BGC1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q8BGC1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q8BGC1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q8BGC1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q8BGC1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q8BGC1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q8BGC1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q8BGC1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q8BGC1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q8BGC1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q8BGC1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q8BGC1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q8BGC1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q8BGC1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q8BGC1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q8BGC1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q8BGC1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q8BGC1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q8BGC1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q8BGC1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q8BGC1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q8BGC1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q8BGC1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q8BGC1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q8BGC1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Q8BGC1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q8BGC1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q8BGC1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q8BGC1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Q8BGC1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8BGC1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8BGC1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8BGC1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8BGC1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8BGC1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms