Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW9

H2-M10.2, Histocompatibility 2, M region locus 10.2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.2Q85ZW9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2-M10.2Q85ZW9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-M10.2Q85ZW9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-M10.2Q85ZW9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-M10.2Q85ZW9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-M10.2Q85ZW9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-M10.2Q85ZW9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-M10.2Q85ZW9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-M10.2Q85ZW9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-M10.2Q85ZW9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-M10.2Q85ZW9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-M10.2Q85ZW9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-M10.2Q85ZW9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-M10.2Q85ZW9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-M10.2Q85ZW9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-M10.2Q85ZW9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-M10.2Q85ZW9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-M10.2Q85ZW9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-M10.2Q85ZW9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-M10.2Q85ZW9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-M10.2Q85ZW9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-M10.2Q85ZW9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-M10.2Q85ZW9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-M10.2Q85ZW9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-M10.2Q85ZW9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-M10.2Q85ZW9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-M10.2Q85ZW9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-M10.2Q85ZW9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-M10.2Q85ZW9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-M10.2Q85ZW9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-M10.2Q85ZW9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
H2-M10.2Q85ZW9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
H2-M10.2Q85ZW9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
H2-M10.2Q85ZW9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2-M10.2Q85ZW9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2-M10.2Q85ZW9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2-M10.2Q85ZW9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2-M10.2Q85ZW9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2-M10.2Q85ZW9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-M10.2Q85ZW9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-M10.2Q85ZW9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-M10.2Q85ZW9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-M10.2Q85ZW9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-M10.2Q85ZW9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-M10.2Q85ZW9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-M10.2Q85ZW9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-M10.2Q85ZW9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-M10.2Q85ZW9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-M10.2Q85ZW9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-M10.2Q85ZW9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-M10.2Q85ZW9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-M10.2Q85ZW9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-M10.2Q85ZW9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-M10.2Q85ZW9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-M10.2Q85ZW9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-M10.2Q85ZW9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-M10.2Q85ZW9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-M10.2Q85ZW9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-M10.2Q85ZW9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-M10.2Q85ZW9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-M10.2Q85ZW9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-M10.2Q85ZW9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-M10.2Q85ZW9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-M10.2Q85ZW9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-M10.2Q85ZW9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-M10.2Q85ZW9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-M10.2Q85ZW9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-M10.2Q85ZW9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2-M10.2Q85ZW9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2-M10.2Q85ZW9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2-M10.2Q85ZW9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2-M10.2Q85ZW9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2-M10.2Q85ZW9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
H2-M10.2Q85ZW9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
H2-M10.2Q85ZW9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-M10.2Q85ZW9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-M10.2Q85ZW9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-M10.2Q85ZW9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-M10.2Q85ZW9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-M10.2Q85ZW9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-M10.2Q85ZW9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-M10.2Q85ZW9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-M10.2Q85ZW9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-M10.2Q85ZW9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-M10.2Q85ZW9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-M10.2Q85ZW9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-M10.2Q85ZW9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-M10.2Q85ZW9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-M10.2Q85ZW9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-M10.2Q85ZW9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-M10.2Q85ZW9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-M10.2Q85ZW9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-M10.2Q85ZW9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-M10.2Q85ZW9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-M10.2Q85ZW9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-M10.2Q85ZW9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-M10.2Q85ZW9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-M10.2Q85ZW9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-M10.2Q85ZW9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-M10.2Q85ZW9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms