Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19■□□□□ 0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-M10.4Q85ZW8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-M10.4Q85ZW8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-M10.4Q85ZW8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-M10.4Q85ZW8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-M10.4Q85ZW8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-M10.4Q85ZW8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-M10.4Q85ZW8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
H2-M10.4Q85ZW8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-M10.4Q85ZW8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-M10.4Q85ZW8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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