Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Srgap3Q812A2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Srgap3Q812A2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Srgap3Q812A2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Srgap3Q812A2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Srgap3Q812A2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Srgap3Q812A2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Srgap3Q812A2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Srgap3Q812A2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Srgap3Q812A2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Srgap3Q812A2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Srgap3Q812A2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Srgap3Q812A2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Srgap3Q812A2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Srgap3Q812A2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Srgap3Q812A2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Srgap3Q812A2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Srgap3Q812A2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Srgap3Q812A2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Srgap3Q812A2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Srgap3Q812A2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Srgap3Q812A2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Srgap3Q812A2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Srgap3Q812A2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Srgap3Q812A2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Srgap3Q812A2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Srgap3Q812A2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Srgap3Q812A2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Srgap3Q812A2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Srgap3Q812A2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Srgap3Q812A2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Srgap3Q812A2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Srgap3Q812A2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Srgap3Q812A2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Srgap3Q812A2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Srgap3Q812A2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Srgap3Q812A2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Srgap3Q812A2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Srgap3Q812A2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Srgap3Q812A2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Srgap3Q812A2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Srgap3Q812A2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Srgap3Q812A2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Srgap3Q812A2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Srgap3Q812A2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Srgap3Q812A2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Srgap3Q812A2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Srgap3Q812A2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Srgap3Q812A2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Srgap3Q812A2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Srgap3Q812A2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Srgap3Q812A2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Srgap3Q812A2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Srgap3Q812A2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Srgap3Q812A2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Srgap3Q812A2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Srgap3Q812A2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Srgap3Q812A2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Srgap3Q812A2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Srgap3Q812A2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Srgap3Q812A2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Srgap3Q812A2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Srgap3Q812A2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Srgap3Q812A2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Srgap3Q812A2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Srgap3Q812A2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Srgap3Q812A2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Srgap3Q812A2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Srgap3Q812A2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Srgap3Q812A2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Srgap3Q812A2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Srgap3Q812A2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Srgap3Q812A2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Srgap3Q812A2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Srgap3Q812A2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Srgap3Q812A2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Srgap3Q812A2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Srgap3Q812A2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Srgap3Q812A2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Srgap3Q812A2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Srgap3Q812A2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Srgap3Q812A2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Srgap3Q812A2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Srgap3Q812A2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Srgap3Q812A2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Srgap3Q812A2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Srgap3Q812A2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Srgap3Q812A2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Srgap3Q812A2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Srgap3Q812A2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Srgap3Q812A2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Srgap3Q812A2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Srgap3Q812A2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Srgap3Q812A2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Srgap3Q812A2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Srgap3Q812A2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Srgap3Q812A2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Srgap3Q812A2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Srgap3Q812A2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Srgap3Q812A2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms