Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZI6

Lrsam1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrsam1Q80ZI6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrsam1Q80ZI6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrsam1Q80ZI6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrsam1Q80ZI6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrsam1Q80ZI6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrsam1Q80ZI6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrsam1Q80ZI6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrsam1Q80ZI6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrsam1Q80ZI6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Lrsam1Q80ZI6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrsam1Q80ZI6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrsam1Q80ZI6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrsam1Q80ZI6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrsam1Q80ZI6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrsam1Q80ZI6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrsam1Q80ZI6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrsam1Q80ZI6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrsam1Q80ZI6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrsam1Q80ZI6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrsam1Q80ZI6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrsam1Q80ZI6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrsam1Q80ZI6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrsam1Q80ZI6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrsam1Q80ZI6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrsam1Q80ZI6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrsam1Q80ZI6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrsam1Q80ZI6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrsam1Q80ZI6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrsam1Q80ZI6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrsam1Q80ZI6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrsam1Q80ZI6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrsam1Q80ZI6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrsam1Q80ZI6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrsam1Q80ZI6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrsam1Q80ZI6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrsam1Q80ZI6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrsam1Q80ZI6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrsam1Q80ZI6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrsam1Q80ZI6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrsam1Q80ZI6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Lrsam1Q80ZI6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrsam1Q80ZI6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrsam1Q80ZI6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrsam1Q80ZI6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrsam1Q80ZI6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrsam1Q80ZI6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrsam1Q80ZI6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrsam1Q80ZI6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrsam1Q80ZI6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrsam1Q80ZI6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrsam1Q80ZI6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrsam1Q80ZI6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrsam1Q80ZI6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrsam1Q80ZI6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrsam1Q80ZI6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrsam1Q80ZI6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrsam1Q80ZI6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrsam1Q80ZI6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrsam1Q80ZI6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrsam1Q80ZI6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrsam1Q80ZI6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrsam1Q80ZI6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrsam1Q80ZI6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrsam1Q80ZI6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrsam1Q80ZI6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrsam1Q80ZI6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lrsam1Q80ZI6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrsam1Q80ZI6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrsam1Q80ZI6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrsam1Q80ZI6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrsam1Q80ZI6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrsam1Q80ZI6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrsam1Q80ZI6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrsam1Q80ZI6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrsam1Q80ZI6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrsam1Q80ZI6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrsam1Q80ZI6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrsam1Q80ZI6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrsam1Q80ZI6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrsam1Q80ZI6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrsam1Q80ZI6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrsam1Q80ZI6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrsam1Q80ZI6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrsam1Q80ZI6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrsam1Q80ZI6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrsam1Q80ZI6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrsam1Q80ZI6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrsam1Q80ZI6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrsam1Q80ZI6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrsam1Q80ZI6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrsam1Q80ZI6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrsam1Q80ZI6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrsam1Q80ZI6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrsam1Q80ZI6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrsam1Q80ZI6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrsam1Q80ZI6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrsam1Q80ZI6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrsam1Q80ZI6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrsam1Q80ZI6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrsam1Q80ZI6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms