Protein–RNA interactions for Protein: Q80ST9

Lca5, Lebercilin, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lca5Q80ST9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lca5Q80ST9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lca5Q80ST9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lca5Q80ST9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lca5Q80ST9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lca5Q80ST9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lca5Q80ST9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Lca5Q80ST9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lca5Q80ST9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lca5Q80ST9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Lca5Q80ST9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lca5Q80ST9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lca5Q80ST9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lca5Q80ST9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lca5Q80ST9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lca5Q80ST9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lca5Q80ST9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lca5Q80ST9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lca5Q80ST9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lca5Q80ST9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lca5Q80ST9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lca5Q80ST9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lca5Q80ST9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lca5Q80ST9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lca5Q80ST9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lca5Q80ST9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lca5Q80ST9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Lca5Q80ST9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lca5Q80ST9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lca5Q80ST9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lca5Q80ST9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lca5Q80ST9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lca5Q80ST9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lca5Q80ST9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lca5Q80ST9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lca5Q80ST9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lca5Q80ST9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lca5Q80ST9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lca5Q80ST9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lca5Q80ST9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lca5Q80ST9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lca5Q80ST9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lca5Q80ST9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lca5Q80ST9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lca5Q80ST9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Lca5Q80ST9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Lca5Q80ST9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lca5Q80ST9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lca5Q80ST9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lca5Q80ST9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lca5Q80ST9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lca5Q80ST9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lca5Q80ST9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lca5Q80ST9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lca5Q80ST9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lca5Q80ST9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lca5Q80ST9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lca5Q80ST9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lca5Q80ST9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lca5Q80ST9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lca5Q80ST9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lca5Q80ST9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lca5Q80ST9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lca5Q80ST9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lca5Q80ST9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lca5Q80ST9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lca5Q80ST9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lca5Q80ST9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Lca5Q80ST9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lca5Q80ST9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lca5Q80ST9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lca5Q80ST9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lca5Q80ST9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lca5Q80ST9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lca5Q80ST9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Lca5Q80ST9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lca5Q80ST9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lca5Q80ST9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lca5Q80ST9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lca5Q80ST9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lca5Q80ST9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lca5Q80ST9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lca5Q80ST9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lca5Q80ST9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lca5Q80ST9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lca5Q80ST9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lca5Q80ST9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lca5Q80ST9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lca5Q80ST9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lca5Q80ST9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lca5Q80ST9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lca5Q80ST9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lca5Q80ST9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lca5Q80ST9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Lca5Q80ST9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lca5Q80ST9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lca5Q80ST9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lca5Q80ST9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lca5Q80ST9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lca5Q80ST9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms