Protein–RNA interactions for Protein: Q80SS5

Ifna12, Interferon alpha-12, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna12Q80SS5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifna12Q80SS5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ifna12Q80SS5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ifna12Q80SS5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifna12Q80SS5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifna12Q80SS5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifna12Q80SS5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifna12Q80SS5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifna12Q80SS5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifna12Q80SS5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifna12Q80SS5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifna12Q80SS5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifna12Q80SS5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifna12Q80SS5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifna12Q80SS5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifna12Q80SS5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifna12Q80SS5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifna12Q80SS5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifna12Q80SS5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifna12Q80SS5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifna12Q80SS5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifna12Q80SS5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifna12Q80SS5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifna12Q80SS5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifna12Q80SS5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifna12Q80SS5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifna12Q80SS5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifna12Q80SS5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifna12Q80SS5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifna12Q80SS5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifna12Q80SS5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifna12Q80SS5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifna12Q80SS5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifna12Q80SS5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifna12Q80SS5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifna12Q80SS5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifna12Q80SS5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifna12Q80SS5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifna12Q80SS5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifna12Q80SS5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifna12Q80SS5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifna12Q80SS5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifna12Q80SS5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifna12Q80SS5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifna12Q80SS5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifna12Q80SS5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifna12Q80SS5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifna12Q80SS5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifna12Q80SS5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ifna12Q80SS5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifna12Q80SS5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifna12Q80SS5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifna12Q80SS5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifna12Q80SS5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifna12Q80SS5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifna12Q80SS5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifna12Q80SS5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifna12Q80SS5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifna12Q80SS5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifna12Q80SS5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifna12Q80SS5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifna12Q80SS5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifna12Q80SS5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifna12Q80SS5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifna12Q80SS5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifna12Q80SS5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifna12Q80SS5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.6 ms