Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sgo2Q7TSY8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sgo2Q7TSY8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sgo2Q7TSY8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sgo2Q7TSY8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sgo2Q7TSY8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sgo2Q7TSY8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sgo2Q7TSY8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sgo2Q7TSY8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sgo2Q7TSY8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sgo2Q7TSY8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sgo2Q7TSY8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sgo2Q7TSY8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sgo2Q7TSY8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sgo2Q7TSY8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sgo2Q7TSY8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sgo2Q7TSY8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sgo2Q7TSY8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sgo2Q7TSY8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sgo2Q7TSY8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sgo2Q7TSY8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sgo2Q7TSY8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sgo2Q7TSY8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sgo2Q7TSY8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sgo2Q7TSY8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sgo2Q7TSY8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sgo2Q7TSY8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sgo2Q7TSY8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Sgo2Q7TSY8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sgo2Q7TSY8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sgo2Q7TSY8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sgo2Q7TSY8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sgo2Q7TSY8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sgo2Q7TSY8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sgo2Q7TSY8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sgo2Q7TSY8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sgo2Q7TSY8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sgo2Q7TSY8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sgo2Q7TSY8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sgo2Q7TSY8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sgo2Q7TSY8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sgo2Q7TSY8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sgo2Q7TSY8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sgo2Q7TSY8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sgo2Q7TSY8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sgo2Q7TSY8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sgo2Q7TSY8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sgo2Q7TSY8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sgo2Q7TSY8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sgo2Q7TSY8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sgo2Q7TSY8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sgo2Q7TSY8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sgo2Q7TSY8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sgo2Q7TSY8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sgo2Q7TSY8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sgo2Q7TSY8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sgo2Q7TSY8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sgo2Q7TSY8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Sgo2Q7TSY8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sgo2Q7TSY8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sgo2Q7TSY8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sgo2Q7TSY8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sgo2Q7TSY8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sgo2Q7TSY8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sgo2Q7TSY8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sgo2Q7TSY8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Sgo2Q7TSY8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Sgo2Q7TSY8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sgo2Q7TSY8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sgo2Q7TSY8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sgo2Q7TSY8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sgo2Q7TSY8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sgo2Q7TSY8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sgo2Q7TSY8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sgo2Q7TSY8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sgo2Q7TSY8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Sgo2Q7TSY8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sgo2Q7TSY8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sgo2Q7TSY8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sgo2Q7TSY8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sgo2Q7TSY8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sgo2Q7TSY8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sgo2Q7TSY8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sgo2Q7TSY8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sgo2Q7TSY8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sgo2Q7TSY8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sgo2Q7TSY8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sgo2Q7TSY8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sgo2Q7TSY8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sgo2Q7TSY8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sgo2Q7TSY8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sgo2Q7TSY8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sgo2Q7TSY8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sgo2Q7TSY8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sgo2Q7TSY8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sgo2Q7TSY8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sgo2Q7TSY8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sgo2Q7TSY8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sgo2Q7TSY8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sgo2Q7TSY8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms