Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSK3

Pcdh8, Protocadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh8Q7TSK3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcdh8Q7TSK3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcdh8Q7TSK3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcdh8Q7TSK3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcdh8Q7TSK3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcdh8Q7TSK3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcdh8Q7TSK3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcdh8Q7TSK3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcdh8Q7TSK3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Pcdh8Q7TSK3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pcdh8Q7TSK3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pcdh8Q7TSK3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcdh8Q7TSK3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcdh8Q7TSK3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcdh8Q7TSK3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcdh8Q7TSK3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcdh8Q7TSK3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcdh8Q7TSK3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcdh8Q7TSK3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcdh8Q7TSK3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcdh8Q7TSK3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcdh8Q7TSK3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcdh8Q7TSK3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcdh8Q7TSK3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcdh8Q7TSK3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcdh8Q7TSK3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcdh8Q7TSK3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcdh8Q7TSK3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcdh8Q7TSK3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcdh8Q7TSK3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcdh8Q7TSK3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcdh8Q7TSK3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcdh8Q7TSK3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcdh8Q7TSK3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcdh8Q7TSK3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcdh8Q7TSK3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcdh8Q7TSK3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcdh8Q7TSK3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcdh8Q7TSK3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcdh8Q7TSK3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcdh8Q7TSK3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcdh8Q7TSK3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcdh8Q7TSK3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcdh8Q7TSK3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcdh8Q7TSK3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcdh8Q7TSK3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcdh8Q7TSK3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcdh8Q7TSK3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcdh8Q7TSK3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcdh8Q7TSK3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcdh8Q7TSK3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcdh8Q7TSK3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcdh8Q7TSK3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcdh8Q7TSK3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcdh8Q7TSK3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcdh8Q7TSK3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcdh8Q7TSK3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcdh8Q7TSK3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcdh8Q7TSK3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcdh8Q7TSK3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcdh8Q7TSK3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcdh8Q7TSK3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcdh8Q7TSK3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcdh8Q7TSK3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcdh8Q7TSK3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcdh8Q7TSK3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcdh8Q7TSK3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcdh8Q7TSK3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcdh8Q7TSK3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcdh8Q7TSK3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcdh8Q7TSK3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcdh8Q7TSK3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcdh8Q7TSK3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcdh8Q7TSK3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcdh8Q7TSK3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcdh8Q7TSK3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcdh8Q7TSK3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcdh8Q7TSK3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcdh8Q7TSK3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcdh8Q7TSK3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcdh8Q7TSK3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcdh8Q7TSK3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcdh8Q7TSK3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcdh8Q7TSK3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcdh8Q7TSK3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcdh8Q7TSK3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcdh8Q7TSK3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcdh8Q7TSK3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcdh8Q7TSK3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcdh8Q7TSK3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcdh8Q7TSK3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcdh8Q7TSK3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcdh8Q7TSK3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcdh8Q7TSK3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcdh8Q7TSK3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcdh8Q7TSK3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcdh8Q7TSK3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcdh8Q7TSK3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcdh8Q7TSK3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcdh8Q7TSK3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms