Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp397Q7TNK4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp397Q7TNK4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfp397Q7TNK4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfp397Q7TNK4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfp397Q7TNK4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfp397Q7TNK4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zfp397Q7TNK4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Zfp397Q7TNK4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp397Q7TNK4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp397Q7TNK4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp397Q7TNK4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp397Q7TNK4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp397Q7TNK4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp397Q7TNK4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp397Q7TNK4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp397Q7TNK4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfp397Q7TNK4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfp397Q7TNK4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfp397Q7TNK4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zfp397Q7TNK4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zfp397Q7TNK4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zfp397Q7TNK4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zfp397Q7TNK4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zfp397Q7TNK4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zfp397Q7TNK4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfp397Q7TNK4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfp397Q7TNK4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfp397Q7TNK4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfp397Q7TNK4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfp397Q7TNK4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp397Q7TNK4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp397Q7TNK4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp397Q7TNK4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp397Q7TNK4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp397Q7TNK4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp397Q7TNK4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp397Q7TNK4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Zfp397Q7TNK4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zfp397Q7TNK4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Zfp397Q7TNK4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Zfp397Q7TNK4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zfp397Q7TNK4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zfp397Q7TNK4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zfp397Q7TNK4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zfp397Q7TNK4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp397Q7TNK4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp397Q7TNK4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp397Q7TNK4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp397Q7TNK4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp397Q7TNK4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp397Q7TNK4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp397Q7TNK4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp397Q7TNK4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp397Q7TNK4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp397Q7TNK4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp397Q7TNK4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zfp397Q7TNK4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zfp397Q7TNK4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zfp397Q7TNK4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zfp397Q7TNK4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zfp397Q7TNK4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Zfp397Q7TNK4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zfp397Q7TNK4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zfp397Q7TNK4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zfp397Q7TNK4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zfp397Q7TNK4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zfp397Q7TNK4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zfp397Q7TNK4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zfp397Q7TNK4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zfp397Q7TNK4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zfp397Q7TNK4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zfp397Q7TNK4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Zfp397Q7TNK4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zfp397Q7TNK4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zfp397Q7TNK4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zfp397Q7TNK4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zfp397Q7TNK4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zfp397Q7TNK4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zfp397Q7TNK4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zfp397Q7TNK4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zfp397Q7TNK4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zfp397Q7TNK4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zfp397Q7TNK4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zfp397Q7TNK4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zfp397Q7TNK4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zfp397Q7TNK4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Zfp397Q7TNK4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Zfp397Q7TNK4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zfp397Q7TNK4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zfp397Q7TNK4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zfp397Q7TNK4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zfp397Q7TNK4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Zfp397Q7TNK4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Zfp397Q7TNK4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Zfp397Q7TNK4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Zfp397Q7TNK4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Zfp397Q7TNK4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zfp397Q7TNK4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zfp397Q7TNK4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 626 ms