Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN58

Tmc8, Transmembrane channel-like protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc8Q7TN58 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmc8Q7TN58 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmc8Q7TN58 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmc8Q7TN58 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmc8Q7TN58 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmc8Q7TN58 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmc8Q7TN58 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmc8Q7TN58 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmc8Q7TN58 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmc8Q7TN58 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmc8Q7TN58 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmc8Q7TN58 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmc8Q7TN58 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmc8Q7TN58 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmc8Q7TN58 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmc8Q7TN58 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmc8Q7TN58 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmc8Q7TN58 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmc8Q7TN58 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmc8Q7TN58 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmc8Q7TN58 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmc8Q7TN58 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmc8Q7TN58 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmc8Q7TN58 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmc8Q7TN58 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmc8Q7TN58 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmc8Q7TN58 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmc8Q7TN58 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmc8Q7TN58 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmc8Q7TN58 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmc8Q7TN58 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmc8Q7TN58 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmc8Q7TN58 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmc8Q7TN58 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmc8Q7TN58 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmc8Q7TN58 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmc8Q7TN58 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmc8Q7TN58 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmc8Q7TN58 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmc8Q7TN58 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmc8Q7TN58 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmc8Q7TN58 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmc8Q7TN58 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmc8Q7TN58 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmc8Q7TN58 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmc8Q7TN58 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmc8Q7TN58 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmc8Q7TN58 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmc8Q7TN58 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmc8Q7TN58 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmc8Q7TN58 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmc8Q7TN58 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmc8Q7TN58 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmc8Q7TN58 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmc8Q7TN58 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmc8Q7TN58 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmc8Q7TN58 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmc8Q7TN58 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmc8Q7TN58 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmc8Q7TN58 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmc8Q7TN58 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmc8Q7TN58 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmc8Q7TN58 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmc8Q7TN58 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmc8Q7TN58 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmc8Q7TN58 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmc8Q7TN58 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmc8Q7TN58 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmc8Q7TN58 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmc8Q7TN58 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmc8Q7TN58 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmc8Q7TN58 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmc8Q7TN58 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmc8Q7TN58 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmc8Q7TN58 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmc8Q7TN58 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmc8Q7TN58 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmc8Q7TN58 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmc8Q7TN58 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmc8Q7TN58 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmc8Q7TN58 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmc8Q7TN58 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmc8Q7TN58 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmc8Q7TN58 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmc8Q7TN58 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmc8Q7TN58 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmc8Q7TN58 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmc8Q7TN58 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmc8Q7TN58 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmc8Q7TN58 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmc8Q7TN58 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmc8Q7TN58 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmc8Q7TN58 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmc8Q7TN58 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmc8Q7TN58 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmc8Q7TN58 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmc8Q7TN58 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmc8Q7TN58 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmc8Q7TN58 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmc8Q7TN58 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms