Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TwistnbQ78WZ7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TwistnbQ78WZ7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TwistnbQ78WZ7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TwistnbQ78WZ7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TwistnbQ78WZ7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TwistnbQ78WZ7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TwistnbQ78WZ7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TwistnbQ78WZ7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TwistnbQ78WZ7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TwistnbQ78WZ7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TwistnbQ78WZ7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TwistnbQ78WZ7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TwistnbQ78WZ7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TwistnbQ78WZ7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TwistnbQ78WZ7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TwistnbQ78WZ7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TwistnbQ78WZ7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TwistnbQ78WZ7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TwistnbQ78WZ7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TwistnbQ78WZ7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TwistnbQ78WZ7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TwistnbQ78WZ7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TwistnbQ78WZ7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TwistnbQ78WZ7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TwistnbQ78WZ7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TwistnbQ78WZ7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TwistnbQ78WZ7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TwistnbQ78WZ7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TwistnbQ78WZ7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TwistnbQ78WZ7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TwistnbQ78WZ7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TwistnbQ78WZ7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TwistnbQ78WZ7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TwistnbQ78WZ7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TwistnbQ78WZ7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TwistnbQ78WZ7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TwistnbQ78WZ7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TwistnbQ78WZ7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TwistnbQ78WZ7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TwistnbQ78WZ7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TwistnbQ78WZ7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TwistnbQ78WZ7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TwistnbQ78WZ7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TwistnbQ78WZ7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TwistnbQ78WZ7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TwistnbQ78WZ7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TwistnbQ78WZ7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TwistnbQ78WZ7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TwistnbQ78WZ7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TwistnbQ78WZ7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TwistnbQ78WZ7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TwistnbQ78WZ7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TwistnbQ78WZ7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TwistnbQ78WZ7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TwistnbQ78WZ7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TwistnbQ78WZ7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TwistnbQ78WZ7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TwistnbQ78WZ7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TwistnbQ78WZ7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TwistnbQ78WZ7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TwistnbQ78WZ7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TwistnbQ78WZ7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TwistnbQ78WZ7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TwistnbQ78WZ7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TwistnbQ78WZ7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TwistnbQ78WZ7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TwistnbQ78WZ7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TwistnbQ78WZ7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TwistnbQ78WZ7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TwistnbQ78WZ7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TwistnbQ78WZ7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TwistnbQ78WZ7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TwistnbQ78WZ7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TwistnbQ78WZ7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TwistnbQ78WZ7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TwistnbQ78WZ7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TwistnbQ78WZ7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TwistnbQ78WZ7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TwistnbQ78WZ7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TwistnbQ78WZ7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TwistnbQ78WZ7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TwistnbQ78WZ7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TwistnbQ78WZ7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TwistnbQ78WZ7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TwistnbQ78WZ7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TwistnbQ78WZ7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TwistnbQ78WZ7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TwistnbQ78WZ7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TwistnbQ78WZ7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TwistnbQ78WZ7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TwistnbQ78WZ7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TwistnbQ78WZ7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TwistnbQ78WZ7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TwistnbQ78WZ7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TwistnbQ78WZ7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TwistnbQ78WZ7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TwistnbQ78WZ7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TwistnbQ78WZ7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TwistnbQ78WZ7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms