Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed3Q78IS1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed3Q78IS1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed3Q78IS1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed3Q78IS1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed3Q78IS1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmed3Q78IS1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmed3Q78IS1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmed3Q78IS1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmed3Q78IS1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmed3Q78IS1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmed3Q78IS1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmed3Q78IS1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmed3Q78IS1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmed3Q78IS1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmed3Q78IS1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed3Q78IS1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed3Q78IS1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed3Q78IS1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed3Q78IS1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed3Q78IS1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed3Q78IS1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed3Q78IS1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed3Q78IS1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed3Q78IS1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed3Q78IS1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed3Q78IS1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed3Q78IS1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed3Q78IS1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed3Q78IS1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed3Q78IS1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed3Q78IS1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed3Q78IS1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed3Q78IS1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed3Q78IS1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed3Q78IS1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed3Q78IS1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed3Q78IS1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed3Q78IS1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed3Q78IS1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed3Q78IS1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed3Q78IS1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed3Q78IS1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed3Q78IS1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed3Q78IS1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed3Q78IS1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed3Q78IS1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed3Q78IS1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed3Q78IS1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed3Q78IS1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed3Q78IS1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmed3Q78IS1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmed3Q78IS1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmed3Q78IS1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmed3Q78IS1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmed3Q78IS1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmed3Q78IS1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmed3Q78IS1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmed3Q78IS1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmed3Q78IS1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmed3Q78IS1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmed3Q78IS1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed3Q78IS1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed3Q78IS1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed3Q78IS1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed3Q78IS1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed3Q78IS1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed3Q78IS1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed3Q78IS1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed3Q78IS1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmed3Q78IS1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmed3Q78IS1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmed3Q78IS1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed3Q78IS1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed3Q78IS1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed3Q78IS1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed3Q78IS1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed3Q78IS1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed3Q78IS1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed3Q78IS1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmed3Q78IS1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmed3Q78IS1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmed3Q78IS1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmed3Q78IS1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmed3Q78IS1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmed3Q78IS1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmed3Q78IS1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmed3Q78IS1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmed3Q78IS1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmed3Q78IS1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmed3Q78IS1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmed3Q78IS1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed3Q78IS1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed3Q78IS1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed3Q78IS1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed3Q78IS1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed3Q78IS1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed3Q78IS1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed3Q78IS1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed3Q78IS1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms