Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nemp1Q6ZQE4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nemp1Q6ZQE4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nemp1Q6ZQE4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nemp1Q6ZQE4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nemp1Q6ZQE4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nemp1Q6ZQE4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nemp1Q6ZQE4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nemp1Q6ZQE4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nemp1Q6ZQE4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nemp1Q6ZQE4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nemp1Q6ZQE4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nemp1Q6ZQE4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nemp1Q6ZQE4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nemp1Q6ZQE4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nemp1Q6ZQE4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nemp1Q6ZQE4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nemp1Q6ZQE4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nemp1Q6ZQE4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nemp1Q6ZQE4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nemp1Q6ZQE4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nemp1Q6ZQE4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nemp1Q6ZQE4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nemp1Q6ZQE4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nemp1Q6ZQE4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nemp1Q6ZQE4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nemp1Q6ZQE4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nemp1Q6ZQE4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nemp1Q6ZQE4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nemp1Q6ZQE4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nemp1Q6ZQE4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nemp1Q6ZQE4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nemp1Q6ZQE4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nemp1Q6ZQE4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nemp1Q6ZQE4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nemp1Q6ZQE4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nemp1Q6ZQE4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nemp1Q6ZQE4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nemp1Q6ZQE4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nemp1Q6ZQE4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nemp1Q6ZQE4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nemp1Q6ZQE4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nemp1Q6ZQE4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nemp1Q6ZQE4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nemp1Q6ZQE4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nemp1Q6ZQE4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nemp1Q6ZQE4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nemp1Q6ZQE4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nemp1Q6ZQE4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms