Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2P8

Neil2, Endonuclease 8-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil2Q6R2P8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Neil2Q6R2P8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Neil2Q6R2P8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Neil2Q6R2P8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Neil2Q6R2P8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Neil2Q6R2P8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Neil2Q6R2P8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Neil2Q6R2P8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Neil2Q6R2P8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Neil2Q6R2P8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Neil2Q6R2P8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Neil2Q6R2P8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Neil2Q6R2P8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Neil2Q6R2P8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Neil2Q6R2P8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Neil2Q6R2P8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Neil2Q6R2P8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Neil2Q6R2P8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Neil2Q6R2P8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Neil2Q6R2P8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Neil2Q6R2P8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Neil2Q6R2P8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Neil2Q6R2P8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Neil2Q6R2P8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Neil2Q6R2P8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Neil2Q6R2P8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Neil2Q6R2P8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Neil2Q6R2P8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Neil2Q6R2P8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Neil2Q6R2P8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Neil2Q6R2P8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Neil2Q6R2P8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Neil2Q6R2P8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Neil2Q6R2P8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Neil2Q6R2P8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Neil2Q6R2P8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Neil2Q6R2P8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Neil2Q6R2P8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Neil2Q6R2P8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Neil2Q6R2P8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Neil2Q6R2P8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Neil2Q6R2P8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Neil2Q6R2P8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Neil2Q6R2P8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Neil2Q6R2P8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Neil2Q6R2P8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Neil2Q6R2P8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Neil2Q6R2P8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Neil2Q6R2P8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Neil2Q6R2P8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Neil2Q6R2P8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Neil2Q6R2P8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Neil2Q6R2P8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Neil2Q6R2P8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Neil2Q6R2P8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Neil2Q6R2P8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Neil2Q6R2P8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Neil2Q6R2P8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Neil2Q6R2P8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Neil2Q6R2P8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Neil2Q6R2P8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Neil2Q6R2P8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Neil2Q6R2P8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Neil2Q6R2P8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Neil2Q6R2P8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Neil2Q6R2P8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Neil2Q6R2P8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Neil2Q6R2P8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Neil2Q6R2P8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Neil2Q6R2P8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Neil2Q6R2P8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Neil2Q6R2P8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Neil2Q6R2P8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Neil2Q6R2P8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Neil2Q6R2P8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Neil2Q6R2P8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Neil2Q6R2P8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Neil2Q6R2P8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Neil2Q6R2P8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Neil2Q6R2P8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Neil2Q6R2P8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Neil2Q6R2P8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Neil2Q6R2P8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Neil2Q6R2P8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Neil2Q6R2P8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Neil2Q6R2P8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Neil2Q6R2P8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Neil2Q6R2P8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Neil2Q6R2P8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Neil2Q6R2P8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Neil2Q6R2P8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Neil2Q6R2P8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Neil2Q6R2P8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Neil2Q6R2P8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Neil2Q6R2P8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Neil2Q6R2P8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Neil2Q6R2P8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Neil2Q6R2P8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Neil2Q6R2P8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Neil2Q6R2P8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms