Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE13

Prrt3, Proline-rich transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt3Q6PE13 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prrt3Q6PE13 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prrt3Q6PE13 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prrt3Q6PE13 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prrt3Q6PE13 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prrt3Q6PE13 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prrt3Q6PE13 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prrt3Q6PE13 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prrt3Q6PE13 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prrt3Q6PE13 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prrt3Q6PE13 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prrt3Q6PE13 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prrt3Q6PE13 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prrt3Q6PE13 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prrt3Q6PE13 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prrt3Q6PE13 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prrt3Q6PE13 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prrt3Q6PE13 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prrt3Q6PE13 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prrt3Q6PE13 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prrt3Q6PE13 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prrt3Q6PE13 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prrt3Q6PE13 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prrt3Q6PE13 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prrt3Q6PE13 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prrt3Q6PE13 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prrt3Q6PE13 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prrt3Q6PE13 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prrt3Q6PE13 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prrt3Q6PE13 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Prrt3Q6PE13 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prrt3Q6PE13 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prrt3Q6PE13 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prrt3Q6PE13 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prrt3Q6PE13 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prrt3Q6PE13 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prrt3Q6PE13 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prrt3Q6PE13 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prrt3Q6PE13 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prrt3Q6PE13 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prrt3Q6PE13 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prrt3Q6PE13 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prrt3Q6PE13 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Prrt3Q6PE13 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prrt3Q6PE13 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prrt3Q6PE13 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prrt3Q6PE13 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prrt3Q6PE13 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prrt3Q6PE13 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prrt3Q6PE13 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prrt3Q6PE13 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prrt3Q6PE13 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Prrt3Q6PE13 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prrt3Q6PE13 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prrt3Q6PE13 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prrt3Q6PE13 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prrt3Q6PE13 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prrt3Q6PE13 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prrt3Q6PE13 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prrt3Q6PE13 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prrt3Q6PE13 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prrt3Q6PE13 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prrt3Q6PE13 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prrt3Q6PE13 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prrt3Q6PE13 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prrt3Q6PE13 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prrt3Q6PE13 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prrt3Q6PE13 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prrt3Q6PE13 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prrt3Q6PE13 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prrt3Q6PE13 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prrt3Q6PE13 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prrt3Q6PE13 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prrt3Q6PE13 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prrt3Q6PE13 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Prrt3Q6PE13 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prrt3Q6PE13 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prrt3Q6PE13 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prrt3Q6PE13 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prrt3Q6PE13 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prrt3Q6PE13 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prrt3Q6PE13 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prrt3Q6PE13 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prrt3Q6PE13 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prrt3Q6PE13 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prrt3Q6PE13 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prrt3Q6PE13 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prrt3Q6PE13 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prrt3Q6PE13 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Prrt3Q6PE13 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prrt3Q6PE13 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Prrt3Q6PE13 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prrt3Q6PE13 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Prrt3Q6PE13 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Prrt3Q6PE13 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prrt3Q6PE13 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Prrt3Q6PE13 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prrt3Q6PE13 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prrt3Q6PE13 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prrt3Q6PE13 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 258.3 ms