Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Ecm29Q6PDI5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ecm29Q6PDI5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ecm29Q6PDI5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ecm29Q6PDI5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ecm29Q6PDI5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ecm29Q6PDI5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ecm29Q6PDI5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ecm29Q6PDI5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ecm29Q6PDI5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ecm29Q6PDI5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ecm29Q6PDI5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ecm29Q6PDI5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ecm29Q6PDI5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ecm29Q6PDI5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ecm29Q6PDI5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ecm29Q6PDI5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ecm29Q6PDI5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ecm29Q6PDI5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ecm29Q6PDI5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ecm29Q6PDI5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ecm29Q6PDI5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ecm29Q6PDI5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ecm29Q6PDI5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Ecm29Q6PDI5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ecm29Q6PDI5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ecm29Q6PDI5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ecm29Q6PDI5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ecm29Q6PDI5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ecm29Q6PDI5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ecm29Q6PDI5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ecm29Q6PDI5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ecm29Q6PDI5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ecm29Q6PDI5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ecm29Q6PDI5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ecm29Q6PDI5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ecm29Q6PDI5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ecm29Q6PDI5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ecm29Q6PDI5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ecm29Q6PDI5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ecm29Q6PDI5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ecm29Q6PDI5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ecm29Q6PDI5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ecm29Q6PDI5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ecm29Q6PDI5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ecm29Q6PDI5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ecm29Q6PDI5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ecm29Q6PDI5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ecm29Q6PDI5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Ecm29Q6PDI5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ecm29Q6PDI5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ecm29Q6PDI5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ecm29Q6PDI5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ecm29Q6PDI5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ecm29Q6PDI5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ecm29Q6PDI5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ecm29Q6PDI5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ecm29Q6PDI5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ecm29Q6PDI5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ecm29Q6PDI5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ecm29Q6PDI5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ecm29Q6PDI5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ecm29Q6PDI5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ecm29Q6PDI5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ecm29Q6PDI5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ecm29Q6PDI5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ecm29Q6PDI5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ecm29Q6PDI5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ecm29Q6PDI5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ecm29Q6PDI5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ecm29Q6PDI5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ecm29Q6PDI5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ecm29Q6PDI5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ecm29Q6PDI5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ecm29Q6PDI5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ecm29Q6PDI5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ecm29Q6PDI5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ecm29Q6PDI5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ecm29Q6PDI5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ecm29Q6PDI5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ecm29Q6PDI5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ecm29Q6PDI5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ecm29Q6PDI5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ecm29Q6PDI5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ecm29Q6PDI5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ecm29Q6PDI5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ecm29Q6PDI5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Ecm29Q6PDI5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ecm29Q6PDI5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ecm29Q6PDI5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ecm29Q6PDI5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ecm29Q6PDI5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ecm29Q6PDI5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ecm29Q6PDI5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ecm29Q6PDI5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ecm29Q6PDI5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ecm29Q6PDI5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ecm29Q6PDI5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ecm29Q6PDI5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ecm29Q6PDI5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms