Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SvoplQ6PDF3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SvoplQ6PDF3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SvoplQ6PDF3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SvoplQ6PDF3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SvoplQ6PDF3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SvoplQ6PDF3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SvoplQ6PDF3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SvoplQ6PDF3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SvoplQ6PDF3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SvoplQ6PDF3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SvoplQ6PDF3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SvoplQ6PDF3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SvoplQ6PDF3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SvoplQ6PDF3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SvoplQ6PDF3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SvoplQ6PDF3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SvoplQ6PDF3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SvoplQ6PDF3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SvoplQ6PDF3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SvoplQ6PDF3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SvoplQ6PDF3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SvoplQ6PDF3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
SvoplQ6PDF3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SvoplQ6PDF3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SvoplQ6PDF3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SvoplQ6PDF3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SvoplQ6PDF3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SvoplQ6PDF3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SvoplQ6PDF3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SvoplQ6PDF3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SvoplQ6PDF3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SvoplQ6PDF3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SvoplQ6PDF3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SvoplQ6PDF3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SvoplQ6PDF3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SvoplQ6PDF3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SvoplQ6PDF3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SvoplQ6PDF3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SvoplQ6PDF3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SvoplQ6PDF3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SvoplQ6PDF3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SvoplQ6PDF3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SvoplQ6PDF3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SvoplQ6PDF3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SvoplQ6PDF3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SvoplQ6PDF3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SvoplQ6PDF3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SvoplQ6PDF3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SvoplQ6PDF3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SvoplQ6PDF3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SvoplQ6PDF3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SvoplQ6PDF3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SvoplQ6PDF3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SvoplQ6PDF3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SvoplQ6PDF3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SvoplQ6PDF3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SvoplQ6PDF3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SvoplQ6PDF3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SvoplQ6PDF3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SvoplQ6PDF3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SvoplQ6PDF3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SvoplQ6PDF3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SvoplQ6PDF3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SvoplQ6PDF3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SvoplQ6PDF3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SvoplQ6PDF3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SvoplQ6PDF3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SvoplQ6PDF3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SvoplQ6PDF3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SvoplQ6PDF3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SvoplQ6PDF3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SvoplQ6PDF3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SvoplQ6PDF3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SvoplQ6PDF3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SvoplQ6PDF3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SvoplQ6PDF3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SvoplQ6PDF3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SvoplQ6PDF3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SvoplQ6PDF3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SvoplQ6PDF3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SvoplQ6PDF3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SvoplQ6PDF3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SvoplQ6PDF3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SvoplQ6PDF3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SvoplQ6PDF3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SvoplQ6PDF3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SvoplQ6PDF3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SvoplQ6PDF3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SvoplQ6PDF3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SvoplQ6PDF3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SvoplQ6PDF3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SvoplQ6PDF3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SvoplQ6PDF3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SvoplQ6PDF3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SvoplQ6PDF3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SvoplQ6PDF3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SvoplQ6PDF3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SvoplQ6PDF3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SvoplQ6PDF3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms