Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S1

Atmin, ATM interactor, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtminQ6P9S1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
AtminQ6P9S1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AtminQ6P9S1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AtminQ6P9S1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AtminQ6P9S1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AtminQ6P9S1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AtminQ6P9S1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AtminQ6P9S1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AtminQ6P9S1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AtminQ6P9S1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AtminQ6P9S1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AtminQ6P9S1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AtminQ6P9S1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AtminQ6P9S1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
AtminQ6P9S1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AtminQ6P9S1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
AtminQ6P9S1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AtminQ6P9S1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AtminQ6P9S1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AtminQ6P9S1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AtminQ6P9S1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AtminQ6P9S1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AtminQ6P9S1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AtminQ6P9S1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AtminQ6P9S1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AtminQ6P9S1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AtminQ6P9S1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AtminQ6P9S1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AtminQ6P9S1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AtminQ6P9S1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AtminQ6P9S1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
AtminQ6P9S1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AtminQ6P9S1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AtminQ6P9S1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AtminQ6P9S1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AtminQ6P9S1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AtminQ6P9S1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AtminQ6P9S1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AtminQ6P9S1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AtminQ6P9S1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AtminQ6P9S1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AtminQ6P9S1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AtminQ6P9S1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AtminQ6P9S1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AtminQ6P9S1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AtminQ6P9S1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AtminQ6P9S1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AtminQ6P9S1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AtminQ6P9S1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AtminQ6P9S1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AtminQ6P9S1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AtminQ6P9S1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AtminQ6P9S1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AtminQ6P9S1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
AtminQ6P9S1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AtminQ6P9S1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AtminQ6P9S1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AtminQ6P9S1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AtminQ6P9S1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AtminQ6P9S1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AtminQ6P9S1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AtminQ6P9S1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AtminQ6P9S1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AtminQ6P9S1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AtminQ6P9S1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AtminQ6P9S1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
AtminQ6P9S1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AtminQ6P9S1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AtminQ6P9S1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AtminQ6P9S1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AtminQ6P9S1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AtminQ6P9S1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AtminQ6P9S1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AtminQ6P9S1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AtminQ6P9S1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AtminQ6P9S1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AtminQ6P9S1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AtminQ6P9S1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AtminQ6P9S1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AtminQ6P9S1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AtminQ6P9S1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AtminQ6P9S1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AtminQ6P9S1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AtminQ6P9S1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AtminQ6P9S1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AtminQ6P9S1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AtminQ6P9S1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AtminQ6P9S1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AtminQ6P9S1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AtminQ6P9S1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AtminQ6P9S1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AtminQ6P9S1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AtminQ6P9S1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AtminQ6P9S1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AtminQ6P9S1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AtminQ6P9S1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AtminQ6P9S1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AtminQ6P9S1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AtminQ6P9S1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AtminQ6P9S1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms