Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T1

Snx19, Sorting nexin-19, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx19Q6P4T1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx19Q6P4T1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx19Q6P4T1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx19Q6P4T1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx19Q6P4T1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx19Q6P4T1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx19Q6P4T1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx19Q6P4T1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx19Q6P4T1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx19Q6P4T1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snx19Q6P4T1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snx19Q6P4T1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snx19Q6P4T1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snx19Q6P4T1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx19Q6P4T1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx19Q6P4T1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx19Q6P4T1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx19Q6P4T1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx19Q6P4T1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx19Q6P4T1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx19Q6P4T1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx19Q6P4T1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx19Q6P4T1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx19Q6P4T1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx19Q6P4T1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx19Q6P4T1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx19Q6P4T1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx19Q6P4T1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx19Q6P4T1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx19Q6P4T1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx19Q6P4T1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx19Q6P4T1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx19Q6P4T1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx19Q6P4T1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx19Q6P4T1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx19Q6P4T1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx19Q6P4T1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx19Q6P4T1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx19Q6P4T1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx19Q6P4T1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx19Q6P4T1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx19Q6P4T1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx19Q6P4T1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx19Q6P4T1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx19Q6P4T1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx19Q6P4T1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx19Q6P4T1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx19Q6P4T1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snx19Q6P4T1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snx19Q6P4T1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snx19Q6P4T1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snx19Q6P4T1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx19Q6P4T1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx19Q6P4T1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx19Q6P4T1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx19Q6P4T1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx19Q6P4T1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx19Q6P4T1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx19Q6P4T1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx19Q6P4T1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx19Q6P4T1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx19Q6P4T1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx19Q6P4T1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx19Q6P4T1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx19Q6P4T1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx19Q6P4T1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx19Q6P4T1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx19Q6P4T1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx19Q6P4T1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx19Q6P4T1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx19Q6P4T1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx19Q6P4T1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx19Q6P4T1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx19Q6P4T1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx19Q6P4T1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx19Q6P4T1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx19Q6P4T1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx19Q6P4T1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx19Q6P4T1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx19Q6P4T1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx19Q6P4T1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx19Q6P4T1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx19Q6P4T1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx19Q6P4T1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx19Q6P4T1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx19Q6P4T1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx19Q6P4T1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx19Q6P4T1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx19Q6P4T1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Snx19Q6P4T1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Snx19Q6P4T1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Snx19Q6P4T1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx19Q6P4T1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx19Q6P4T1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx19Q6P4T1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx19Q6P4T1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx19Q6P4T1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx19Q6P4T1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx19Q6P4T1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx19Q6P4T1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms